Вопросы медицинской химии (ISSN 0042-8809)

Моделирование трехмерной структуры цитохрома р450 1a2 и поиск его новых лигандов

   
Белкина Н.В., Скворцов В.С., Иванов А.С., Арчаков А.И.
Идентификатор PubMed: 9916262
Год: 1998 том: 44  выпуск:5  страницы: 464-473
Реферат: Вещества, способные ингибировать цитохром Р450 1А2 (CYP1A2), представляют собой перспективный класс новых лекарственных средств, применение которых в клинической практике может стать важным звеном в профилактике онкологических заболеваний. Данная работа посвящена компьютерному моделированию трехмерной структуры CYP1A2 и поиску его новых ингибиторов с помощью скрининга баз данных низкомолекулярных соединений. Моделирование CYP1A2 основывалось на гомологии с бактериальными цитохромами P450 с известной трехмерной структурой. С целью оптимизации структуры активного центра CYP1A2 были созданы модели его комплексов с характерными субстратами (кофеином и 7-этоксирезурфином) с последующей их оптимизацией методами молекулярной динамики в присутствии растворителя. Далее, средствами программ DockSearch и LeapFrog были созданы модели 24 комплексов CYP1A2 с известными лигандами, для которых известны экспериментальные значения константы диссоциации (Kd). На основе этих комплексов была построена 3D-QSAR модель с хорошей предсказательной силой. На заключительном этапе был выполнен поиск лигандов CYP1A2 в базе низкомолекулярных соединений (более 23000 веществ из базы данных фирмы Maybridge и 112 известных лигандов CYP1A2 из базы данных Metabolite фирмы MDL). Было получено 680 потенциальных лигандов CYP1A2 с предсказанной величиной Kd, сравнимой с известными лигандами. В это число вошли 73 соединения из 112 известных лигандов, введенных в качестве внутреннего контроля в тестируемую базу данных.
Загрузить PDF:
Ссылка: Белкина Н.В., Скворцов В.С., Иванов А.С., Арчаков А.И., Моделирование трехмерной структуры цитохрома р450 1a2 и поиск его новых лигандов, Вопросы медицинской химии, 1998, том: 44(5), 464-473.
Список литературы
 2002(Том:48)
 2001(Том:47)
 2000(Том:46)
 1999(Том:45)
 1998(Том:44)
 1997(Том:43)
 1996(Том:42)