Анализ модельной структуры сайта связывания антител против 2,4-дихлорофеноксиуксусной кислоты

   


1. МГУ им. М.В.Ломоносова, Химический факультет, кафедра Химической Энзимологии
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
Идентификатор PubMed: 14564733
Год: 2003 том: 49  выпуск:3  страницы: 238-249
Реферат: По данным об аминокислотной последовательности методом гомологии построены пространственные структуры для трех антител, специфичных к пестициду 2,4-дихлоро-феноксиуксусной кислоте (2,4-D). Во всех случаях была получена сходная структура сайта связывания. Наиболее важным остатком во взаимодействии с 2,4-D является тирозин, служащий "стенкой" сайта связывания и предположительно образующий p-стекинг взаимодействие с ароматическим ядром лиганда. Другие стенки полости образованы гидрофобными остатками. На входе в полость в 2-х из 3-х структур находятся остатки глутаминовой кислоты. На базе результатов докинга 2,4-D и его аналогов качественно объяснены данные по кросс-реактивности. По результатам моделирования предлагается замена глутаминовой кислоты H50 на входе в сайт связывания на серин или лизин для устранения электростатического отталкивания с лигандом и предположительного улучшения его связывания. Соответствующие мутации были проверены виртуальным мутагенезом на модельной структуре.
Загрузить PDF:
Ссылка: Колясников О.В., Григоренко В.Г., Егоров А.М., Анализ модельной структуры сайта связывания антител против 2,4-дихлорофеноксиуксусной кислоты, Биомедицинская химия, 2003, том: 49(3), 238-249.
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)