Генетический алгоритм молекулярного 3D дизайна биологически активных соединений

   


1. Челябинский государственный университет
2. Университет Тюбингена
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
УДК: 541.69:541.572+615.781.6     
Год: 2004 том: 50  приложение: 1  страницы: 42-48
Реферат: Предложен алгоритм DesPot для молекулярного 3D дизайна потенциальных биологически активных соединений. Алгоритм включает в себя процедуры генетической генерации новых молекулярных структур, оптимизации их геометрии с поиском глобального минимума и оценки биологической активности в рамках 3D-QSAR метода BiS. Для генерации молекулярных структур используется генетический алгоритм. Подход приводит к более быстрому достижению оптимума в ряде задач дискретной оптимизации. В качестве критерия оптимальности принята вероятность проявления соединением биологической активности. Для дизайна новых соединений используется выборка (популяция) соединений с известными показателями активности. Геометрия вновь полученных структур оптимизируется в силовом поле ММ3. Производится ориентация молекул в модельном рецепторе в рамках алгоритма BiS, рассчитываются характеристики взаимодействия и вероятность проявления биологической активности. Алгоритм тестирован на 40 видах биологической активности
Загрузить PDF:
Ссылка: Потемкин В.А., Гришина М.А., Пожиленкова Г.В., Микушина К.М., Лауфер С., Генетический алгоритм молекулярного 3D дизайна биологически активных соединений, Биомедицинская химия, 2004, том: 50(приложение 1), 42-48.
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)