Моделирование механизмов ферментативных реакций комбинированными методами квантовой и молекулярной механики

   


1. Московский Государственный Университет, Химический факультет, Кафедра физической химии, лаборатория химической кибернетики
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
УДК: 577.15     
Год: 2004 том: 50  приложение: 1  страницы: 49-55
Реферат: Разработан и доведен до программной реализации оригинальный вариант комбинированного метода квантовой и молекулярной механики (КМ/ММ), предназначенный для моделирования химических реакций в белковом окружении, в частности, для описания механизмов ферментативных реакций. Метод основан на теории потенциалов эффективных фрагментов и предполагает разделение ММ-подсистемы на совокупность гибких цепей малых фрагментов, взаимодействующих с квантовой подсистемой и между собой. Созданная компьютерная программа метода КМ/ММ позволяет находить стационарные точки на сложных многомерных потенциальных поверхностях систем, состоящих из нескольких сотен атомов. В приложениях рассмотрены реакции гидролиза пептидных связей, катализируемые сериновыми протеазами, реакции передачи протонов по ориентированным сетям водородных связей в ионных каналах
Загрузить PDF:
Ссылка: Немухин А.В., Григоренко Б.Л., Епифановский Е.М., Рогов А.В., Моделирование механизмов ферментативных реакций комбинированными методами квантовой и молекулярной механики, Биомедицинская химия, 2004, том: 50(приложение 1), 49-55.
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)