Реферат: Обзор посвящен описанию основных существующих и разрабатываемых технологий для экспериментальной валидации потенциальных белков-мишеней, предсказанных in silico методами сравнительной геномики и биоинформатики. Так как эта проблема на настоящий момент до конца не решена, то в обзоре приведено описание широкого круга методов, пригодных для валидации потенциальных мишеней.
В обзоре рассмотрены: (1) применение протеомных технологий (контроль экспрессии потенциальных белков-мишеней и их вариабельности, анализ белок-белковых взаимодействий); (2) геномные технологии в экспериментальной валидации мишеней (инактивация целевого гена, подавление транскрипции, разрушение целевой мРНК, подавление трансляции); (3) методы прямой инактивации целевого белка (моноклональные антитела, фотоинактивация белков, одноцепочечные и внутриклеточные антитела, аптамеры); (4) высокопроизводительные технологии; (5) валидация мишеней in vivo.
Загрузить PDF:
Ссылка: Иванов А.С., Веселовский А.В., Арчаков А.И., Методы экспериментальной валидации потенциальных белков-мишеней для новых лекарственных средств, Биомедицинская химия, 2005, том:
51(1), 2-18.
82. Chowdhury P.S., Vasmatzis G. (2003) Methods Mol. Bid., 207, 237-254 Scholar google search
83. van Wyngaardt W., Malatji Т., Mashau C., Fehrsen J., Jordaan F., Miltiadou D., du Plessis D.H. (2004) BMC Biotechnology, 4, 6 Scholar google search
84. Toleikis L., Broders O., Dubel S. (2004) Methods Mol. Med., 94, 447-458. Scholar google search
85. Tanaka T., Lobato M.N., Rabbitts Т.Н. (2003) J. Mol. Biol, 331, 1109-1120 Scholar google search
86. Donim M., Morea V., Desiderio A., Pashkoulov D., Villani M.E., Tramontane A., Benvenuto E. (2003) J Mol. Biol., 330, 323-332 Scholar google search
102. Barsky V., Perov A., Tokalov S., Chudinov A., Kreindlin E., Sharonov A., Kotova E., Mirzabekov A. (2002) J. Biomol Screen., 7, 247-257 Scholar google search
108. Amatruda J.F., Shepard J.L., Stern H.M., Zon L.I. (2002) Cancer Cell, 1 , 229-231 Scholar google search
109. Shin J.Т., Fishman M.C. (2002) Ann. Rev. Genomics Hum. Genet, 3, 311-340. Scholar google search
110. Berman J., Hsu K., Look A.T. (2003) Br. J. Haematol., 123, 568-57 Scholar google search
111. Tomasiewicz H.G., Flaherty D.В., Soria J.P., Wood J.G. (2002) J. Neurosci. Res., 70, 734-745 Scholar google search
112. Tornell J., Smith M. (2002) Drug Discov. Today, 7, 461-470 Scholar google search
113. Ahum A., Holt K.H., Platl K.A., Sands А.Т., Zambrowicz B.P. (2002) Trends Biotechnol, 20, 36-42 Scholar google search
114. Russ A., Stiunm G., Augitstm M., Sedlmeir R., Wattier S., Nehls M. (2002) Drug Discov. Today, 7, 1175-1183 Scholar google search
115. Zambrowicz B.P., Sands A.T. (2004) Drug Discov. Today. TARGETS, 3, 198-207 Scholar google search
116. RubinsteinA.L. (2003) Curr.Opin.DrugDiscov.Devel., 6, 218-223. Scholar google search
117. SumanasS, LinS. (2004) Drug Discov. Today:TARGETS, 3, 89-96 Scholar google search
118. Huffier P., Granato M., Brand M., Mullins M.C., Hammerschnndt M., Kane D.A.,Odenthal L., van Eeden F.J., Jiang Y.J., Heisenberg С.Р., Kelsh R.N., Furutani-Seiki M., Vogelsang E., Beuchle D., Schach U., Fabian C., Nuss/ein-lb/hardC. (1996) Development., 123, 1-3 Scholar google search
119. Haffter P., Nusslem-Volhard C. (1996) Int. J. Dev. Biol., 40, 221-22 Scholar google search
120. Wargehus A., Ehngsen S., Fjose A. (1999) Biochem. Biophys Res Commun, 263, 156-61 Scholar google search
121. Li Y.X., Farrell M.J., Liu R., Mohanty N., Kirby M.L. (2000) Dev. Biol. 217, 394-405 Scholar google search
122. Zhao Z., Cao X. , Li M., Meng A. (2001) Dev. Biol, 229, 215-223 Scholar google search
123. Dodd A., Chambers S.P., Love D.R. (2004) FEBS Lett., 561, 89-93. Scholar google search
125. Sternbeig P.W., Han M. (1998) Trends Genet., 14, 466-472. Scholar google search
126. Lee J. , Nam S., Hwang S.B., Hong M., Kwon J.Y., Joetig K.S., Im S.H., Shim J., Park M.C. (2004) J Biochem. Mol. Biol., 37, 107-113. Scholar google search
132. Jackson L.K., Phillips M.A. (2002) Curr. Top. Med. Chem., 2, 425-438. Scholar google search
133. VITA (Validation In Vivo of Targets and Assays for Antiinfectives) technology. (http://www.cubist.com/ar2000text/discovery.html) Scholar google search
