Масс-спектрометрический анализ для типирования вируса гепатита C

   


1. НИИ физико-химической медицины РосЗдрава
2. НИИ физико-химической медицины РосЗдрава, ГУ НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
3. ГУ НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
4. ЦНИИ эпидемиологии МЗ РФ
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
Идентификатор PubMed: 15850217
Год: 2005 том: 51  выпуск:1  страницы: 41-47
Реферат: Определение генотипа вируса гепатита С (ВГС) давно стало рутинной процедурой при лабораторной диагностики ВГС инфекции. Установление генотипа ВГС позволяет прогнозировать течение заболевания и назначить адекватный курс противовирусной терапии. В настоящее время на основании особенностей нуклеотидной последовательности 5'-нетранслируемой области вирусного генома выявлены 11 основных генотипов и более 70 подтипов ВГС. В России наиболее распространены генотипы вируса 1а, 1в, 2а, 3а, более редко встречаются 4 и 5 типы. Хотя "золотым стандартом" генотипирования является определение нуклеотидной последовательности, разработаны разнообразные тесты, включая гибридизацию с типоспецифичными зондами и типоспецифичную амплификацию, позволяющие проводить типирование ВГС более быстро и дешево. Тем не менее, все эти методы позволяют выявлять типоспецифичные контексты с определенной степенью достоверности и уступают по точности прямому определению нуклеотидной последовательности интересующих локусов вирусной РНК. Для типирования ВГС нами реализован принцип детекции типоспецифичных точечных мутаций в 5'-нетранслируемой области вирусного генома с использованием технологии минисеквенирования и определения молекулярных масс продуктов реакции на MALDI-TOF масс-спектрометре Reflex-IV ("Bruker Daltoniсs", Германия). Предложенный метод использован для типирования ВГС в 69 образцах, среди них 1а генотип выявлен в 4,5% случаях, 1в - 48%, 2а - 4,5%, 3а - 29%, 4 - 1,5%. В 9 (13%) образцах зарегистрирована микст-инфекция. Правильность установления генотипа с использованием технологии минисеквенирования и определения молекулярных масс продуктов реакции на времяпролетном масс-спектрометре подтверждена секвенирование анализируемого фрагмента кДНК ВГС.
Загрузить PDF:
Ссылка: Ильина Е.Н., Малахова М.В., Генерозов Э.В., Говорун В.М., Арчаков А.И., Покровский В.И., Масс-спектрометрический анализ для типирования вируса гепатита C, Биомедицинская химия, 2005, том: 51(1), 41-47.
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)