Компьютерное конструирование поликетидов с заданными свойствами

   


1. ГУ НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
2. Норвежский университет наук и технологий
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
УДК: 544.165      Идентификатор PubMed: 18078066
Год: 2007 том: 53  выпуск:5  страницы: 522-531
Реферат: Предложен подход к рациональному конструированию новых поликетидов с заданным спектром биологической активности. Разработана компьютерная программа BioGenPharm, которая на основе заданных пользователем входных параметров генерирует комбинаторные библиотеки поликетидов, осуществляет прогноз спектра биологической активности для сгенерированных структур и отбор среди них молекул с требуемыми свойствами. Для прогноза спектра биологической активности поликетидов использовался алгоритм PASS (http://www.ibmc.msk.ru/PASS). Оценка его прогностической способности для предсказания биологической активности поликетидов была выполнена на тестовой выборке, содержащей 242 природных макролида из базы данных Dictionary of Natural Products. Она показала, что средняя точность прогноза составляет 75,5%. Рассмотрена проблема выбора пороговых значений вероятности наличия активности (Ра), обеспечивающих оптимальные сочетания таких параметров как чувствительность, специфичность и согласие, характеризующих качество прогноза. В качестве примера применения описанного метода была сгенерирована виртуальная библиотека аналогов эритромицина и отобраны вещества, для которых снижена вероятность гепатотоксического действия.
Загрузить PDF:
Ссылка: Сергейко А.П., Степанчикова А.В., Соболев Б.Н., Зотчев С.Б., Лагунин А.А., Филимонов Д.А., Поройков В.В., Компьютерное конструирование поликетидов с заданными свойствами, Биомедицинская химия, 2007, том: 53(5), 522-531.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1007/s11828-008-1005-0
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)