Выявление дифференциально-экспрессирующихся белков с использованием автоматического мета-анализа протеомных публикаций

   


1. Государственное учреждение Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
2. Карлов Университет в Праге, факультет общей медицины, Институт патофизиологии
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
УДК: 004.912, 615.03, 577.29      Идентификатор PubMed: 19351029
Год: 2009 том: 55  выпуск:1  страницы: 5-14
Реферат: В работе рассматривается автоматический метод поиска дифференциально-экспрессирующихся белков (ДЭБ) в научных статьях по протеомике. Из электронной версии журнала "Proteomics" и открытого ресурса PubMedCentral были отобраны полнотекстовые публикации, посвященные различным протеомным исследованиям. В результате подсчета частот встречаемости названий белков в статьях получен список, на 86% совпадающий с ранее опубликованным в работе (Petrak et al., Proteomics (2008) 8, 1744) перечнем ДЭБ тканей человека. Независимо от целей экспериментального исследования и применявшегося аналитического метода анализа, различия в уровне экспрессии наблюдаются для белков семейств аннексинов, пероксиредоксинов, а также альфа-енолазы, триозофосфатизомеразы и HSP60. Среди опубликованных ДЭБ также присутствуют сывороточный альбумин, катепсин D и виментин. В статьях наиболее часто встречаются белки, участвующие в воспалении и формировании иммунного ответа, либо входящие в состав системы регуляции и передачи сигнала. Большинство из найденных белков изучаются в контексте исследования патогенеза онкологических заболеваний, болезней сердечно-сосудистой и нервной систем.
Загрузить PDF:
Ссылка: Пономаренко Е.А., Лисица А.В., Петрак И., Мошковский С.А., Арчаков А.И., Выявление дифференциально-экспрессирующихся белков с использованием автоматического мета-анализа протеомных публикаций, Биомедицинская химия, 2009, том: 55(1), 5-14.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750809010028
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)