Предсказание взаимосвязанных белков методамисравнительной геномики in silico

   


1. НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
УДК: 543.51.061:543.54.45:543.8      Идентификатор PubMed: 19662999
Год: 2009 том: 55  выпуск:3  страницы: 230-246
Реферат: Обзор посвящен компьютерному поиску взаимосвязанных белков методами сравнительной геномики. Возрастающие возможности биотехнологий по секвенированию новых геномов привели к накоплению данных о последовательностях миллионов генов. Функции большинства этих генов неизвестны, и только для малой части кодируемых ими белков функция может быть определена в эксперименте. Возникает потребность в надежных и достоверных алгоритмах предсказания функций (аннотации) белков методами in silico. В обзоре описаны основные подходы сравнительной геномики, использующие как традиционный способ переноса функций на основании гомологии последовательностей, так и с использованием контекстных свойств генов (методы филогенетических профилей и метод генов-соседей). Применение современных методов сравнительной геномики позволяет получить корректные функциональные аннотации для более чем половины всех белков протеома.
Загрузить PDF:
Ссылка: Пятницкий М.А., Лисица А.В., Арчаков А.И., Предсказание взаимосвязанных белков методамисравнительной геномики in silico, Биомедицинская химия, 2009, том: 55(3), 230-246.
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)