Компьютерные методы предсказания субстратной специфичности цитохромов P450

   


1. Учреждение Российской академии медицинских наук Научно-исследовательский Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича РАМН
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
DOI: 10.18097/pbmc20105601090      УДК: 577.152.3      Идентификатор PubMed: 21328914
Год: 2010 том: 56  выпуск:1  страницы: 90-100
Реферат: Цитохромы Р450 являются важными ферментами участвующими в метаболизме множества лекарств. От состава и активности этих ферментов во многом зависит распределение лекарств в организме, их фармакологический и токсический эффект. Поэтому предсказание судьбы соединений в организме является насущной задачей для разработки новых лекарственных препаратов уже на самых ранних их этапах. Разные изоформы цитохромы Р450 могут окислять разнообразные химические соединения, причем их субстратная специфичность не коррелирует с таксономической классификацией данного суперсемейства. В работе рассмотрены основные методы предсказания субстратной специфичности цитохромов Р450 in silico. Эти методы разделены в зависимости от первичной информации, используемой в анализе: предсказание на основе аминокислотных последовательностей, структур субстратов (фармакофорные, QSAR модели, экспертные системы) и пространственной структуры белка-мишени (метод молекулярного докинга, оценка энергии взаимодействия). Обсуждаются как общие причины сложности прогноза субстратной специфичности цитохромов Р450 с использованием компьютерных методов, так и преимущества и ограничения описанных подходов.
Загрузить PDF:
Ссылка: Веселовский А.В., Соболев Б.Н., Жаркова М.С., Арчаков А.И., Компьютерные методы предсказания субстратной специфичности цитохромов P450, Биомедицинская химия, 2010, том: 56(1), 90-100.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750810010105
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)