Сравнительный термодинамический анализ взаимодействия тромбина с антитромбиновыми аптамерами и их гетеродимерной конструкцией

   


1. Учреждение Российской академии медицинских наук научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
Тип: Краткое сообщение
DOI: 10.18097/pbmc20105603404      УДК: 577.113.6      Идентификатор PubMed: 20695220
Год: 2010 том: 56  выпуск:3  страницы: 404-411
Реферат: Аптамеры, селективно взаимодействующие с анион-связывающими экзосайтами 1 и 2 тромбина, объединяли в димерные олигонуклеотидные конструкции с помощью поли-(dT)-линкера длиной 35 нуклеотидов. Образование комплексов тромбина с аптамерами и их гетеро- и гомодимерными конструкциями измеряли на оптическом биосенсоре Biacore-3000. Значения KD, полученные для гетеро- и гомодимерных конструкций были соответственно в 25-30 раз и 2-3 раза ниже значений KD для исходных аптамеров. Анализ температурных зависимостей KD в интервале 10°С-40°С показал, что аффинность увеличивается с понижением температуры. При этом изменение энтальпии ΔH при образовании комплексов тромбина с аптамерами и гетеродимерной конструкцией было практически одинаково. Значение изменения энтропии ΔS при образовании комплекса тромбина с гетеродимерной конструкцией было в 1,5-2 раза выше, чем значение ΔS для комплексов с аптамерами. При возрастании температуры с 10°С до 37°С скорости как образования, так и распада комплексов увеличивались. При этом скорость диссоциации комплекса тромбин с гетеродимерной конструкцией была заметно ниже, чем для комплексов с аптамерами, при обеих температурах.
Загрузить PDF:
Ссылка: Рахметова С.Ю., Радько С.П., Гнеденко О.В., Бодоев Н.В., Иванов А.С., Арчаков А.И., Сравнительный термодинамический анализ взаимодействия тромбина с антитромбиновыми аптамерами и их гетеродимерной конструкцией, Биомедицинская химия, 2010, том: 56(3), 404-411.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750811020144
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)