1. Учреждение Российской академии медицинских наук Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича РАМН 2. Российский государственный медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Реферат: Бактериальные L-аспарагиназы (LА), используемые в качестве противоопухолевых препаратов, проявляют свою активность только в виде гомотетрамеров, поскольку активные центры в этих ферментах расположены в зоне контакта субъединиц. Высокая стабильность тетрамерных комплексов аспарагиназ обусловлена образованием ионных пар между субъединицами, что должно приводить и к высокой специфичности молекулярного узнавания при олигомеризации этих ферментов. В данной работе мы изучали специфичность молекулярного узнавания при олигомеризации ряда бактериальных LА с помощью оптического биосенсора, работающего на эффекте поверхностного плазмонного резонанса. Была обнаружена практически абсолютная специфичность молекулярного узнавания - устойчивые тетрамерные комплексы образовывались только из субъединиц одного вида. На примере двух мутантных вариантов LА Helicobacter pylori было показано, что специфичность молекулярного узнавания заметно снижается при наличии даже одной точечной мутации в зоне контакта субъединиц высоко гомологичных близкородственных ферментов.
7. Lubkowski J., Dauter M., Aghaiypour K., Wlodawer A., Dauter Z. (2003) Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr., 59(Pt 1), 84-92. . CrossRef Scholar google search
8. Marlborough D.I., Miller D.S., Cammack K.A. (1975) Biochim. Biophys. Acta, 386, 576-589. . CrossRef Scholar google search
9. Asthagiri D., Paliwal A., Abras D., Lenhoff A.M., Paulaitis M.E. (2005) Biophys. J., 88, 3300-3309. . CrossRef Scholar google search
10. Balbo A., Minor K.H., Velikovsky C.A., Mariuzza R.A., Peterson C.B., Schuck P. (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, 81-86. . CrossRef Scholar google search
11. Torreri P., Ceccarini M., Macioce P., Petrucci T.C. (2005) Ann. Ist. Super. Sanita, 41, 437-441. . Scholar google search
24. Jaskolski M., Kozak M., Lubkowski J., Palm G., Wlodawer A. (2001) Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr., 57(Pt 3 ), 369-377. . Scholar google search
25. Bendtsen J.D., Nielsen H., von Heijne G., Brunak S. (2004) J. Mol. Biol., 340, 783-795. . CrossRef Scholar google search
32. Case D.A., Darden T.A., Cheatham T.E. III, Simmerling C.L., Wang J., Duke R.E., Luo R., Merz K.M., Wang B., Pearlman D.A., Crowley M., Brozell S., Tsui V., Gohlke H., Mongan J., Hornak V., Cui G., Beroza P., Schafmeister C., Caldwell J.W., Ross W.S., Kollman P.A. (2004) AMBER 8, University of California San Francisco. . Scholar google search
33. Miller M., Mohana Rao J.K., Wlodawer A., Gribskov M.R. (1993) FEBS Lett., 328, 275-279. . CrossRef Scholar google search