Компьютерные классификационные модели взаимосвязи структуры химических соединений и лекарств с их способностью проникать через гематоэнцефалический барьер
Реферат: Способность лекарственных веществ проходить через гематоэнцефалический барьер (ГЭБ), обозначенная как ВВВ+ и ВВВ для не проникающих ГЭБ, является одним из важнейших свойств соединений, действующих на центральную нервную систему (ЦНС). В работе представлены результаты по моделированию взаимосвязи структуры органических лекарственных препаратов и их способности преодолевать ГЭБ. Использованы литературные данные по ВВВ+/- для 1513 соединений. Для указанного ряда веществ 1276 были отнесены к ВВВ+ и 237 к ВВВ. Компьютерное моделирование взаимосвязи структура-активность осуществлялось по двум направлениям: метод структурной аналогии ("read-across") и линейный дискриминантный анализ (ЛДА) на основе физико-химических дескрипторов. Главным параметром, определяющим проницаемость через ГЭБ, оказалась сумма водород-связывающих донорно-акцепторных факторов.
Загрузить PDF:
Ссылка: Раевский О.А., Солодова С.Л., Раевская О.Е., Липлавский Я.В., Манхольд Р., Компьютерные классификационные модели взаимосвязи структуры химических соединений и лекарств с их способностью проникать через гематоэнцефалический барьер, Биомедицинская химия, 2012, том: 58(3), 246-256.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750812010131
Список литературы
1. Бредбери М. (1983) Концепция гематоэнцефалического барьера (пер. с англ.), Медицина, М. . Scholar google search
2. Покровский В.М., Коротько Г.Ф., Кобрин В.И. и др. (1997) Физиология человека: Учебник, Медицина, М. . Scholar google search
4. Lipinski C.A., Lombardo F., Dominy B.W., Feeney P.J. (1997) Adv. Drug Delivery Rev., 23, 3-25. . Scholar google search
5. van de Waterbeemd H., Camenisch G., Folkers G., Chretien J.R., Raevsky O.A. (1998) J. Drug Targeting, 6, 151-165. . CrossRef Scholar google search
6. Adenot M., Lahana R.J. (2004) Chem. Inf. Comput. Sci., 44, 239-248. . Scholar google search
7. Zhao Y.H., Abraham M.H., Ibrahim A., Fish P.V., Cole S., Lewis M.L., de Groot M.J., Reynolds D.P. (2007) J. Chem. Inf. Model., 47, 170-175. . Scholar google search
8. Raevsky O.A. (2004) Minireview in Medicinal Chemistry, 4, 1041-1052. . Scholar google search
9. Raevsky O.A. (2008) In: Molecular Drug Properties. Measurement and Prediction (Mannhold R., еd.). Wiley-VCH Verlag GmbH & Co.KGaA, Weinheim, pp. 127-154. . Scholar google search
10. Ertl P. (2008) Polar surface area In: Molecular Drug Properties. Measurement and Prediction (Mannhold R., еd.) Wiley-VCH Verlag GmbH & Co.KGaA, Weinheim, pp. 127-154. . Scholar google search
11. Raevsky O.A., Skvortsov V.S. (2005) SAR & QSAR in Environmental Research, 15, 287-300. . Scholar google search
12. Hansch C., Leo A., Hoekman D. (1995) Exploring QSAR: Hydrophobic, Electronic, and Steric Constants. American Chemical Society, Washington, DC. . Scholar google search
13. Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Трепалин С.В. (26.02.1999) Программа HYBOT, Роспатент № 990090. . Scholar google search
14. SYBYL: SYBYL 8.0, Tripos International, 1699 South Hanley Rd., St. Louis, Missouri, 63144, USA. . Scholar google search
15. Раевский О.А., Скворцов В.С. (27.09.2004) Программа 3D HYBOT, Роспатент № 2004612207. . Scholar google search
17. Organization for Economic Cooperation and Development. Guidance on Grouping of Chemicals, OECD, Paris (2007). . Scholar google search
18. European Chemical Agency, Guidance on Information Requirements and Chemical Safety Assessment, Chapter R6, QSAR and grouping of chemicals, ECHA, Helsinki (2008). . Scholar google search
19. Mendelejeff D. (1869) Zeitschrift fur Chemie, 12, 405-406. . Scholar google search
21. Dimitrov S., Mekenyan O. (2010) An Introduction to Read-Across for the Prediction of the Effects of Chemicals, in "In Silico Toxicology. Principles and Applications". (Cronin M.T.D., Madden J.C., eds.), RSC, Cambridge, pp. 372-384. . Scholar google search
22. Diderich R. (2010) Tools for Category Formation and Read-Across: Overview of the OECD (Q)SAR Application Toolbox, ibid., pp. 385-407. . Scholar google search
23. Jeliazkova N., Jaworska J., Worth A.P. (2010) Open Source Tools for Read-Across and Category Formation, ibid, pp. 408-445. . Scholar google search
24. Raevsky О.A., Grigor`ev V.Yu., Modina E.A., Worth A. (2010) SAR & QSAR in Environmental Research, 21, 265-275. . Scholar google search
25. Раевский О.А., Герасименко В.А., Трепалин С.В. (26.02.1999) Программа MOLDIVS, Роспатент № 990093. . Scholar google search
26. Gerasimenko V.A., Trepalin S.V., Raevsky O.A. (2000) MOLDIVS - A New Program for Molecular Similarity and Diversity Calculations, in "Molecular Modelling and Prediction of Bioactivity", (Gundertofe K., Jorgensen F., eds.), Kluwer Academic/Plenum Publ., pp. 423-424. . Scholar google search
28. PharmaAlgorithms. ADME Boxes, Version 3.0; PharmaAlgorithms, Inc.: 591 Indian Road, Toronto, ON M6P 2C4, Canada. . Scholar google search
29. Lipinski C.A. Drugs structure and properties, past and present. Can we design drugs with beautiful properties? http://www.iainm.demon.co.uk/spring99/lipins_n.pdf . Scholar google search
