Штаммовая классификация staphylococcus aureus посредством прямого масс-спектрометрического профилирования

   


1. ФГУ НИИ Физико-химической медицины ФМБА России
2. НИИ Антимикробной химиотерапии СГМА России
3. Bruker Daltonik GmbH
Тип: Экспериментальное/клиническое исследование
DOI: 10.18097/pbmc20125805501      УДК: 57.088.5:543.51      Идентификатор PubMed: 23289292
Год: 2012 том: 58  выпуск:5  страницы: 501-513
Реферат: Staphylococcus aureus - один из наиболее интересных для клинических исследований видов микроорганизмов, обладающий большим штаммовым разнообразием, в первую очередь за счёт вариабельности факторов вирулентности и патогенности. Целью настоящего исследования явилась апробация метода быстрой штаммовой дифференциации стафилококков по определённому признаку на основании регистрации отличительных особенностей MALDI масс-спектров, накапливаемых в ходе прямого белкового профилирования бактериальной клетки. В качестве модельных признаков, регистрируемых как штаммовые отличия, были выбраны продукция β-лактамазы и α-гемолизина, обусловленные наличием генов blaZ и hla соответственно. Математический анализ совокупности MALDI масс-спектров, накопленных для 53 изолятов S. aureus c применением генетического алгоритма кластеризации, позволил построить две независимые классификационные модели, способные дифференцировать штаммы по рассматриваемым признакам. По статистическому вкладу в модель каждого масс-пика были выявлены наиболее значимые пики (массы), которые можно рассматривать как маркеры штаммовых различий стафилококков. Построенные диагностические модели отличались коэффициентами чувствительности и специфичности, которые составили 97,5% и 82,5% для разделения штаммов по признаку продукции β-лактамазы и 90,0% и 88,7% по наличию α-гемолизина.
Загрузить PDF:
Ссылка: Корниенко М.А., Ильина Е.Н., Боровская А.Д., Эдельштейн M.В., Сухорукова M.В., Кострцева М., Говорун В.М., Штаммовая классификация staphylococcus aureus посредством прямого масс-спектрометрического профилирования, Биомедицинская химия, 2012, том: 58(5), 501-513.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750813010095
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)