Вариабельность относительного содержания геномной ДНК человека при метагеномном анализе микробиоты кишечника

   


1. Институт физико-химической медицины ФМБА, Москва; Казанский (Приволжский) федеральный университет, Казань; Московский физико-технический университет, Москва
2. Институт физико-химической медицины ФМБА, Москва; Казанский (Приволжский) федеральный университет, Казань
3. Институт физико-химической медицины ФМБА
Тип: Клиническое исследование
DOI: 10.18097/PBMC20146006695      УДК: 57.083.1      Идентификатор PubMed: 25552511
Год: 2014 том: 60  выпуск:6  страницы: 695-701
Реферат: Проведено сравнительное сопоставление семи различных способов выделения тотальной ДНК из образца кала, рекомендуемых в протоколах метагеномного анализа состава микробиоты кишечника человека. Исследована вариабельность относительного содержания в таких образцах ДНК человека, регистрируемого по результатам высокопроизводительного секвенирования с использованием генетического анализатора SOLiD 4. Показано, что масса взятого в обработку первичного материала и методика, реализуемая для выделения тотальной ДНК, не оказывают существенного влияния на конечную величину относительной доли ДНК человека, которая не превышает 1% для здоровой популяции. Продемонстрированная инвариантность этого показателя позволяет расценивать его повышение при метагеномном анализе как один из потенциальных маркеров воспалительных заболеваний кишечника.
Загрузить PDF:
Дополнительные материалы:
Ссылка: Кострюкова Е.С., Карпова И.Ю., Ларин А.К., Попенко А.С., Тяхт А.В., Ильина Е.Н., Вариабельность относительного содержания геномной ДНК человека при метагеномном анализе микробиоты кишечника, Биомедицинская химия, 2014, том: 60(6), 695-701.
Список цитируемой литературы (Bibliography)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)