1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия; Институт молекулярной биологии имени В.А. Энгельгардта РАН, Москва, Россия 2. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
Реферат: Оптический биосенсор, работающий на эффекте поверхностного плазмонного резонанса (SPR; surface plasmon resonance) (SPR-биосенсор) – высокоэффективный прибор, который позволяет осуществлять прямую регистрацию межмолекулярных взаимодействий в реальном времени без дополнительного использования каких-либо меток или сопряжённых процессов. В качестве самостоятельного методического подхода данный тип биосенсоров особенно эффективен при анализе различного рода лиганд-рецепторных взаимодействии. Использование SPR-биосенсора позволяет подтвердить результаты исследований межмолекулярных взаимодействий, выполненных на сложных биологических системах (аффинное профилирование различных групп белков и т.д.). В последнее время показана потенциальная возможность применения SPR-биосенсора в молекулярном фишинге – прямом аффинном связывании целевых молекул из сложных биологических смесей на поверхности оптического чипа с последующей их элюцией для идентификации методами тандемной масс-спектрометрии LC-MS/MS. Использование SPR-биосенсора в такого рода исследованиях позволяет: (а) осуществить оптимальный подбор условий для иммобилизации лиганда, которые способствуют наиболее эффективному аффинному разделению биологического образца; (б) провести молекулярный фишинг для последующей масс-спектрометрической идентификации белков; (в) валидировать аффинное взаимодействие идентифицированных белков с иммобилизованным лигандом. В данном обзоре применение SPR-технологии рассмотрено в контексте исследований молекулярного фишинга реальных биологических объектов, выполнявшихся в последнее время в Институте биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича.
Загрузить PDF:
Ссылка: Иванов А.С., Медведев А.Е., Оптический плазмонно-резонансный биосенсор в молекулярном фишинге, Биомедицинская химия, 2015, том: 61(2), 231-238.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750816010078
10. Иванов А.С. (2012) Современные технологии в медицине, 4, 142-153. Scholar google search
11. Иванов А.С., Згода В.Г., Арчаков А.И. (2011) Биоорг. химия, 37, 8-21. Scholar google search
12. Ershov P., Mezentsev Yu., Gnedenko O., Mukha D., Yantsevich A., Britikov V., Kaluzhskiy L., Yablokov E., Molnar A., Ivanov A., Lisitsa A., Gilep A., Usanov S., Archakov A. (2012) Proteomics, 12, 3295–3298. CrossRef Scholar google search
14. Ivanov A.S., Medvedev A., Ershov P., Molnar A., Mezentsev Y., Yablokov E., Kaluzhsky L., Gnedenko O., Buneeva O., Haidukevich I., Sergeev G., Lushchyk A., Yantsevich A., Medvedeva M., Kozin S., Popov I., Novikova S., Zgoda V., Gilep A., Usanov S., Lisitsa A., Archakov A. (2014) Proteomics, 14, 2261–2274. CrossRef Scholar google search
16. Upadhaya A., Kosterin I., Kumar S., von Arnim C.A., Yamaguchi H., Fändrich M., Walter J., Thal D.R. (2014) Brain, 137(pt 3), 887-903. CrossRef Scholar google search
25. Tamaoka A., Endoh R., Shoji S., Takahashi H., Hirokawa K., Teplow D.B., Selkoe D.J., Mori H. (1996) Neurobiol. Aging, 17, 405–414. CrossRef Scholar google search
26. Schulze H., Schuler A., Stuber D., Dobeli H., Langen H., Huber G. (1993) J. Neurochem., 60, 1915–1922. CrossRef Scholar google search
27. Verdier Y., Földi I., Sergeant N., Fülöp L., Penke Z., Janáky T., Szücs M., Penke B. (2008) J. Pept. Sci., 14, 755–762. CrossRef Scholar google search
31. Ivanov A.S., Medvedev A., Ershov P., Molnar A., Mezentsev Y., Yablokov E., Kaluzhsky L., Gnedenko O., Buneeva O., Haidukevich I., Sergeev G., Lushchyk A., Yantsevich A., Medvedeva M., Kozin S., Popov I., Novikova S., Zgoda V., Gilep A., Usanov S., Lisitsa A., Archakov A. (2014) Proteomics, 14, 2261–2274. CrossRef Scholar google search
32. Caswell A.H., Corbett A.M. (1985) J. Biol. Chem., 260, 6892–6898. Scholar google search
33. Harvey J.W. (2008) in: Clinical Biochemistry of Domestic Animals (Kaneko J.J., Harvey J.W., Bruss M.L., еds.), London: Academic Press, pp. 173–240. Scholar google search
43. Crumeyrolle-Arias M., Medvedev A., Cardona A., Barritault D., Glover V. (2003) J. Neurochem., 84, 618-620. CrossRef Scholar google search
44. Crumeyrolle-Arias M., Buneeva O., Zgoda V., Kopylov A., Cardona A., Tournaire M-C., Pozdnev V., Glover V., Medvedev A. (2009) J. Neurosci. Res., 87, 2763–2772. CrossRef Scholar google search
46. Buneeva O., Gnedenko O., Zgoda V., Kopylov A., Glover V., Ivanov A., Medvedev A., Archakov A. (2010) Proteomics, 10, 23-37. CrossRef Scholar google search
