Классификационные модели взаимосвязи структуры лекарственных соединений и их P-гликопротеиновой активности

   


1. Институт физиологически активных веществ Российской академии наук, Черноголовка, Россия
Тип: Биоинформатика
DOI: 10.18097/PBMC20166202173      УДК: 541.69+519.25+518.5      Идентификатор PubMed: 27143376
Год: 2016 том: 62  выпуск:2  страницы: 173-179
Реферат: С использованием методов линейного дискриминантного анализа, случайного леса и опорных векторов созданы 33 классификационные модели субстратной специфичности 177 лекарственных соединений по отношению к Р-гликопротеину. QSAR моделирование проведено с использованием двух стратегий. Первая стратегия заключалась в переборе всех возможных комбинаций из 1¸5 дескрипторов на основе 7 наиболее значимых молекулярных дескрипторов с ясной физико-химической интерпретацией. Во втором случае было использовано последовательное включение в модель до 5 дескрипторов, начиная с лучшего одиночного дескриптора. Эту стратегию применяли для набора из 387 DRAGON дескрипторов. В результате было установлено, что только одна из 33-х моделей обладает необходимыми статистическими параметрами. Данная модель была сконструирована с помощью метода линейного дискриминантного анализа на основе одиночного дескриптора Н-связи (SCad). Она имеет хорошие статистические характеристики, как внутренней кросс-валидацией, так и внешней валидацией с применением 44 новых соединений. Это подтверждает важную роль водородной связи в процессах, связанных с проникновением химических соединений через гематоэнцефалический барьер
Загрузить PDF:
Дополнительные материалы:
Ссылка: Григорьев В.Ю., Солодова С.Л., Полианчик Д.Е., Раевский О.А., Классификационные модели взаимосвязи структуры лекарственных соединений и их P-гликопротеиновой активности, Биомедицинская химия, 2016, том: 62(2), 173-179.
Список литературы
 2017(Том:63)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)