Статус метилирования генов GSTP1, APC и RASSF1 в образцах рака предстательной железы человека: сравнительный анализ диагностической информативности методов MS-HRM и гибридизации на ДНК-чипах illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip

   


1. Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства, Москва, Россия
2. Московский физико-технический институт (государственный университет), Долгопрудный, Россия
3. Московский государственный медико-стоматологический университет имени А.И. Евдокимова, Москва, Россия
4. Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства, Москва, Россия; Московский физико-технический институт (государственный университет), Долгопрудный, Россия
Тип: Клинико-диагностическое исследование
DOI: 10.18097/PBMC20166206708      УДК: 616.65-006.6;61:575      Идентификатор PubMed: 28026816
Год: 2016 том: 62  выпуск:6  страницы: 708-714
Реферат: В настоящее время существует потребность в молекулярных маркерах рака предстательной железы (РПЖ), уточняющих стратификацию пациентов по категориям риска и дополняющих факторы клинического прогноза. Одним из молекулярных процессов, происходящих при развитии РПЖ, является изменение метилирования ДНК. Для оценки метилирования генов в лабораторной диагностике может быть использована чувствительная к метилированию ПЦР с анализом кривой плавления высокого разрешения (Methylation-Sensitive High Resolution Melting – MS-HRM). Этот метод особенно перспективен с точки зрения небольшого количества требуемой ДНК (10 нг). На сегодняшний день накоплено много данных по изучению уровня метилирования ДНК в образцах РПЖ, полученных с использованием технологии ДНК-чипов “Infinium HumanMethylation450 BeadChip” (HM450). Однако неизвестно, согласуются ли результаты MS-HRM с данными чип-гибридизации. Целью данной работы был сравнительный анализ диагностической информативности методов MS-HRM и чип-гибридизации HM450 при определении степени метилирования генов GSTP1, APC и RASSF1 в образцах, полученных от больных РПЖ. Показано, что метод MS-HRM позволяет дифференцировать образцы опухолевой ткани РПЖ от образцов гистологически неизмененной ткани предстательной железы по уровню метилирования каждого из генов. Анализ данных чип-гибридизации подтвердил результаты, полученные с помощью MS-HRM. Разности уровней метилирования генов GSTP1, APC и RASSF1 между опухолевой тканью и гистологически неизмененной тканью у каждого больного РПЖ, определённые MS-HRM или гибридизацией на чипах, согласовались друг с другом. Таким образом, оценка уровня метилирования генов GSTP1, APC и RASSF1 с помощью MS-HRM может стать основой для разработки лабораторного теста, уточняющего диагностику РПЖ.
Загрузить PDF:
Ссылка: Скородумова Л.О., Бабалян К.А., Султанов Р., Васильев А.О., Говоров А.В., Пушкарь Д.Ю., Прилепская Е.А., Даниленко С.А., Генерозов Э.В., Ларин А.К., Кострюкова Е.С., Шарова Е.И., Статус метилирования генов GSTP1, APC и RASSF1 в образцах рака предстательной железы человека: сравнительный анализ диагностической информативности методов MS-HRM и гибридизации на ДНК-чипах illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip, Биомедицинская химия, 2016, том: 62(6), 708-714.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S199075081702007X
Список литературы
 2019(Том:65)
 2018(Том:64)
 2017(Том:63)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 В печати