ПЦР-анализ абсолютного числа копий транскриптов хромосомы 18 человека в клетках печени и линии HepG2

   


1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
Тип: Экспериментальное исследование
DOI: 10.18097/PBMC20176302147      Идентификатор PubMed: 28414286
Год: 2017 том: 63  выпуск:2  страницы: 147-153
Реферат: Используя обратную транскрипцию совместно с количественной ПЦР в реальном времени или цифровой капельной ПЦР, проведено профилирование транскриптома хромосомы 18 человека в гепатоцитах печени и клетках гепатобластомы (клеточная линия HepG2) в терминах абсолютного числа копий каждого транскрипта на клетку. Количественная представленность транскриптов варьирует в пределах от 0,006 до 9635 и от 0,011 до 4819 копий на клетку для клеточной линии HepG2 и гепатоцитов печени, соответственно. Обнаружена значительная корреляция между экспрессией генов хромосомы 18 в гепатоцитах и клетках HepG2: коэффициент корреляции Спирмана составил 0,81. Распределение частоты транскриптов по их количественной представленности является бимодальным для клеток линии HepG2 и унимодальным для гепатоцитов печени. Биоинформатический анализ дифференциальной экспрессии генов выявил, что гены хромосомы 18, показывающие повышенную экспрессию в клетках HepG2 по сравнению с гепатоцитами, ассоциированы с процессами клеточного деления и клеточной адгезии. Предполагается, что усиленная экспрессия этих генов связана с пролиферативной активностью культивируемых клеток HepG2. Различия транскриптомных профилей должны учитываться при использовании клеток линии HepG2 в качестве модели гепатоцитов печени.
Загрузить PDF:
Ссылка: Киселёва Я.Ю., Птицын К.Г., Тихонова О.В., Радько С.П., Курбатов Л.К., Вахрушев И.В., Згода В.Г., Пономаренко Е.А., Лисица А.В., Арчаков А.И., ПЦР-анализ абсолютного числа копий транскриптов хромосомы 18 человека в клетках печени и линии HepG2, Биомедицинская химия, 2017, том: 63(2), 147-153.
Список литературы
 2017(Том:63)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 2011(Том:57)
 2010(Том:56)
 2009(Том:55)
 2008(Том:54)
 2007(Том:53)
 2006(Том:52)
 2005(Том:51)
 2004(Том:50)
 2003(Том:49)