Применение ДНК-аптамеров для обогащения низкопредставленных белков в клеточных экстрактах для количественной детекции методом мониторинга выбранных реакций

   


1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
2. Российский научный центр рентгенорадиологии, Москва, Россия
Тип: Экспериментальное исследование
DOI: 10.18097/PBMC20186401005      Идентификатор PubMed: 29460828
Год: 2018 том: 64  выпуск:1  страницы: 5-9
Реферат: В работе исследовано соотношение между количеством белковой мишени (таргетного белка) в сложном биологическом образце и его количеством, определяемым масс-спектрометрическим методом мониторинга выбранных реакций (МВР) при аффинном обогащении таргетного белка с использованием аптамеров, иммобилизованных на твёрдой фазе. Тромбин человека, добавленный в известных концентрациях к клеточным экстрактам, полученным из бактериальных клеток, был использован как модельный таргетный белок. Показано, что аффинное обогащение тромбина в клеточных экстрактах с помощью тромбин-связывающего аптамера, иммобилизованного на поверхности магнитных микросфер, приводит приблизительно к 10-кратному увеличению концентрации таргетного белка и 100-кратному снижению нижнего значения диапазона концентраций, в котором возможна его количественная детекция методом МВР без существенной интерференции со стороны других пептидов, присутствующих в триптическом гидролизате.
Загрузить PDF:
Ссылка: Птицын К.Г., Новикова С.Е., Киселёва Я.Ю., Мойса А.А., Курбатов Л.К., Фарафонова Т.Е., Радько С.П., Згода В.Г., Арчаков А.И., Применение ДНК-аптамеров для обогащения низкопредставленных белков в клеточных экстрактах для количественной детекции методом мониторинга выбранных реакций, Биомедицинская химия, 2018, том: 64(1), 5-9.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750818020105
Список литературы
 2018(Том:64)
 2017(Том:63)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 В печати