Сравнительное протеомное профилирование ядерной и цитозольной фракций клеточных линий различного происхождения

   


1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
2. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия; Национальный исследовательский университет “Высшая школа экономики”, Москва, Россия
Тип: Экспериментальное исследование
DOI: 10.18097/PBMC20186403233      Идентификатор PubMed: 29964258
Год: 2018 том: 64  выпуск:3  страницы: 233-240
Реферат: Исследование протеома ядерной фракции является важной задачей, поскольку большая часть процессов, происходящих в клетке, инициируется в ядре. Разработка и выбор условий фракционирования клеточных лизатов и параметров масс-спектрометрического детектирования и обработки данных в настоящее время продолжают оставаться актуальными. Представленный в работе масс-спектрометрический анализ апробирован на линиях клеток, происходящих из разных тканей: HL-60 (периферическая кровь), HepG2 (печень), EA.hy926 (эндотелий сосудов). Продемонстрирована высокая воспроизводимость результатов и их согласованность с биологическими свойствами исследованных объектов. Благодаря использованию разного типа клеточных линий выявлен набор из 16 белков, чьи количественные показатели (LFQ – Label-free Quantification Intensity) позволяют дискриминировать ядерную и цитозольную фракции вне зависимости от происхождения клеток. Также предложен набор из 16 белков, чьи LFQ связаны с индивидуальными признаками клеточных линий вне зависимости от фракции. Эти панели белков могут использоваться как индикаторы успешного фракционирования клеточного или тканевого лизата.
Загрузить PDF:
Дополнительные материалы:
Ссылка: Вахрушев И.В., Новикова C.Е., Цветкова А.В., Пятницкий М.А., Ярыгин К.Н., Сравнительное протеомное профилирование ядерной и цитозольной фракций клеточных линий различного происхождения, Биомедицинская химия, 2018, том: 64(3), 233-240.
Список литературы
 2018(Том:64)
 2017(Том:63)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 В печати