Создание обобщённой модели предсказания ингибирования нейраминидазы вируса гриппа различных штаммов

   


1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
Тип: Экспериментальное исследование
DOI: 10.18097/PBMC20186403247      Идентификатор PubMed: 29964260
Год: 2018 том: 64  выпуск:3  страницы: 247-252
Реферат: Представлены предварительные результаты универсальной модели предсказания значений IC50 ингибиторов нейраминидазы вируса гриппа произвольного штамма. В уравнениях предсказания использовали в качестве независимых переменных энергетические параметры комплексов, полученные в результате моделирования 30 вариантов структур нейраминидаз, с последующим докингом и симуляцией молекулярной динамики. В качестве лигандов в работе рассмотрены молекулы известных лекарственных средств – ингибиторов нейраминидазы – осельтамивира, занамивира и перамивира, а также субстрат этого фермента – MUNANA. Использование расчётных параметров комплексов ингибиторов с нейраминидазой не дало возможности построить корреляционное уравнение с приемлемыми параметрами (R2£0,3). Однако, если использовать информацию о связывании с нейраминидазой субстрата, относительно которого были измерены величины IC50, то полученные уравнения предсказания IC50 становятся значимыми (R2³0,55). Делается вывод, что уравнения, объединяющие не только различные лиганды, но и множество вариантов таргетного белка их связывающих, в случае использования как целевого параметра величины IC50 должны учитывать и связывание субстрата, относительно которого в эксперименте измеряли величину IC50. В этом случае, использование смоделированных белков оправдано. Предсказательная сила таких моделей критически зависит от качества моделирования комплексов.
Загрузить PDF:
Ссылка: Микурова А.В., Скворцов В.С., Создание обобщённой модели предсказания ингибирования нейраминидазы вируса гриппа различных штаммов, Биомедицинская химия, 2018, том: 64(3), 247-252.
Список литературы
 2018(Том:64)
 2017(Том:63)
 2016(Том:62)
 2015(Том:61)
 2014(Том:60)
 2013(Том:59)
 2012(Том:58)
 В печати