На основании разработанного ранее подхода по моделированию структуры активного центра ферментов с неизвестной пространственной структурой (метод слепка) (Веселовский и др. Биохимия, 65, 1072-1079) построена модель активного центра фермента моноаминоксидазы МАО Б. Показано, что построенная модель хорошо отражает форму и размер участка связывания субстратов и ингибиторов в полости активного центра этого фермента. Сопоставление слепков активных центров МАО А и Б показало, что активные центры этих ферментов отличаются между собой по размерам и форме. Оценка достоверности полученной модели активного центра МАО Б была проведена с использованием трех соединений, различающихся по ингибиторной активности, относящихся к разным химическим классам и имеющих заместители в различных положениях. Показано, что слабые ингибиторы МАО Б не могут поместиться в полости активного центра, тогда как у их 'гибких' близких аналогов (эффективно тормозящих активность МАО Б) существуют конформации, позволяющие им поместиться в построенной полости. Это указывает, что построенный слепок правильно отражает структуру активного центра МАО Б. Построенный слепок МАО Б может быть использован для поиска новых ингибиторов этого фермента и предварительной оценки перспективности их синтеза и биологического тестирования
Загрузить PDF:
Цитирование:
Тихонова О.В., Иванов А.С., Медведев А.Е., Веселовский А.В. (2001) Моделирование активного центра моноаминоксидазы типа B методом построения слепка. Вопросы медицинской химии, 47(6), 642-651.
Тихонова О.В. и др. Моделирование активного центра моноаминоксидазы типа B методом построения слепка // Вопросы медицинской химии. - 2001. - Т. 47. -N 6. - С. 642-651.
Тихонова О.В. и др., "Моделирование активного центра моноаминоксидазы типа B методом построения слепка." Вопросы медицинской химии 47.6 (2001): 642-651.
Тихонова, О. В., Иванов, А. С., Медведев, А. Е., Веселовский, А. В. (2001). Моделирование активного центра моноаминоксидазы типа B методом построения слепка. Вопросы медицинской химии, 47(6), 642-651.
Medvedev A.E., Ivanov A.S., Kamyshanskaya N. S., KirkelA. Z., Moskvitina T.A., Gorkin V.Z., Li N.Y., and Marshakov V.Yu. (1995) Biochem. Mol. Biol. Int., 36, 113- 122. Scholar google search
Веселовский А.В., Медведев А.Е., Тихонова О.В., Скворцов B.C., Иванов А.С. (2000) Биохимия, 65, 1072- 1079. Scholar google search
Veselovsky А.V., Tikhonova О.V., Skvortsov V.S., Medvedev A.E., and Ivanov A.S. (2001) QSAR and SAR in Environmental Research. 2001. 12. 345- 358. Scholar google search
Medvedev A.E., Ivanov A.S., and Veselovsky A.V. (2000) in: "Monoamine oxidases, milestones in deprenyl research", Medicina Publisher House Co., Budapest, (Eds. K.Magyar, E.S.Vizi). p. 33- 50. Scholar google search
SYBYL 6.4. Tripos Inc. 1699 South Hanley Road. St. Louis. Missouri. 63144. USA. Scholar google search
Kneubuhler S., Thull U., Altomare C., Carta V., Gaillard P., Corrupt P.- A., Carotti A., and Testa B. (1995) J. Med. Chem., 38, 3874- 3883. Scholar google search
Bernard S., Paillat С., Oddos T., Seman M., and Milcent R. (1995) Eur. J. Med. Chem., 30, 471- 482. Scholar google search
Medvedev A.E., Ivanov A.S., Veselovsky A.V., Skvortsov V.S., and Archakov A.I. (1996) J. Chem. Inf. Comput. Sci., 36, 664- 671. Scholar google search
Lebreton L., Curet O., Gueddari S., Mazouz F., Bernard S., Burstein C., and Milcent R. (1995) J. Med. Chem., 38, 4786- 4792. Scholar google search
ISIS™/Base: MDL Drug Data Report, Molecular Design Limited Information Systems, Inc., 14600 Catalina Street, San Leandro, California, 94577, USA. 1997. Scholar google search
Medvedev A.E., Ivanov A.S., Veselovsky A.V., Skvortsov V.S., and Archakov A.I. (1996) J. Chem. Inf. Comput. Sci., 36, 664- 671. Scholar google search
Gottowik J., Malherbe P., Lang G., Daprada M., and Cesura A.M. (1995) Eur. J. Biochem., 230, 934- 942. Scholar google search
Cesura A.M., and Pletscher A. (1992) Progr. Drag Res., 38, 171- 297. Scholar google search
Mabic S., and Castagnoli N. (1996) J. Med. Chem., 39, 3694- 3700. Scholar google search
Palmer S.L., Mabic S., and Castagnoli N. (1997) J. Med. Chem., 40,1982- 1989. Scholar google search
Krueger M.J., Efange S.M.N., Michelson R.H., and Singer T.P. (1992) Biochemistry., 31, 5611- 5615. Scholar google search
Glover V. 1997 In: Antidepressant: New pharmacological strategies. Ed.: Skolnick Ph. Humana press, Toto, NJ p. 69- 80. Scholar google search
