Масс-спектрометрический анализ для типирования вируса гепатита C

   
Ильина Е.Н.1, Малахова М.В.1, Генерозов Э.В.1, Говорун В.М.2, Арчаков А.И.3, Покровский В.И.4

1. НИИ физико-химической медицины РосЗдрава
2. НИИ физико-химической медицины РосЗдрава, ГУ НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
3. ГУ НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
4. ЦНИИ эпидемиологии МЗ РФ
Раздел: Экспериментальное/клиническое исследование
Идентификатор PubMed: 15850217
Год: 2005  том: 51  выпуск: 1  страницы: 41-47
Определение генотипа вируса гепатита С (ВГС) давно стало рутинной процедурой при лабораторной диагностики ВГС инфекции. Установление генотипа ВГС позволяет прогнозировать течение заболевания и назначить адекватный курс противовирусной терапии. В настоящее время на основании особенностей нуклеотидной последовательности 5'-нетранслируемой области вирусного генома выявлены 11 основных генотипов и более 70 подтипов ВГС. В России наиболее распространены генотипы вируса 1а, 1в, 2а, 3а, более редко встречаются 4 и 5 типы. Хотя "золотым стандартом" генотипирования является определение нуклеотидной последовательности, разработаны разнообразные тесты, включая гибридизацию с типоспецифичными зондами и типоспецифичную амплификацию, позволяющие проводить типирование ВГС более быстро и дешево. Тем не менее, все эти методы позволяют выявлять типоспецифичные контексты с определенной степенью достоверности и уступают по точности прямому определению нуклеотидной последовательности интересующих локусов вирусной РНК. Для типирования ВГС нами реализован принцип детекции типоспецифичных точечных мутаций в 5'-нетранслируемой области вирусного генома с использованием технологии минисеквенирования и определения молекулярных масс продуктов реакции на MALDI-TOF масс-спектрометре Reflex-IV ("Bruker Daltoniсs", Германия). Предложенный метод использован для типирования ВГС в 69 образцах, среди них 1а генотип выявлен в 4,5% случаях, 1в - 48%, 2а - 4,5%, 3а - 29%, 4 - 1,5%. В 9 (13%) образцах зарегистрирована микст-инфекция. Правильность установления генотипа с использованием технологии минисеквенирования и определения молекулярных масс продуктов реакции на времяпролетном масс-спектрометре подтверждена секвенирование анализируемого фрагмента кДНК ВГС.
Загрузить PDF:
Ссылка:

Ильина Е.Н., Малахова М.В., Генерозов Э.В., Говорун В.М., Арчаков А.И., Покровский В.И. (2005) Биомедицинская химия, 51(1), 41-47.
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)