Интеграза – фермент, необходимый для репликации вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1). В настоящее время ароматические производные дикетокарбоновых кислот рассматриваются в качестве перспективных ингибиторов интегразы ВИЧ-1. Одно из соединений, относящихся к этому классу, находится на стадии клинических испытаний. Мы создали выборку из 90 производных дикетокарбоновых кислот и провели обучение программы PASS. Точность прогноза антиинтегразной активности при скользящем контроле с исключением по одному составила 99% . Среди более чем 700 тысяч структур коммерчески доступных химических соединений проведен поиск новых потенциальных ингибиторов интегразы ВИЧ-1. Отобрано и исследовано 8 веществ, для которых эта активность была предсказана с относительно высокой вероятностью; для двух соединений наличие антиинтегразной активности подтверждено в эксперименте.
Акимов Д.В. и др. Компьютерный поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1 // Биомедицинская химия. - 2005. - Т. 51. -N 3. - С. 335-340.
Акимов Д.В. и др., "Компьютерный поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1." Биомедицинская химия 51.3 (2005): 335-340.
Акимов, Д. В., Филимонов, Д. А., Приказчикова, Т. А., Готтих, М. Б., Поройков, В. В. (2005). Компьютерный поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1. Биомедицинская химия, 51(3), 335-340.
Patella F.J.J., Delaney K.M., Moorman A.C. (1998) N. Engl. J. Med. 38, 853-860. Scholar google search
Ramratnam B., Mittler J.E., Zhang L., Boden D., Hurley A., Fang E., Macken C.A., Perelson A.S., Markowitz M., Ho D.D. (2000) Nat. Med. , 6, 82-85. Scholar google search
Finzi D., Blankson J., Siliciano J.D., Margolick J.B., Chadwick K., Pierson T., Smith K., Lisziewicz J., Lori E., Flexner C., Quinn T.C., Chaisson R.E., Rosenberg E., Walker В., Gange S., Gallant J., Siliciano R.F. (1999) Nat. Med. , 5, 512-517. Scholar google search
Johnson A.A., Marchand C., Pommier Y. (2004) Curr. Top. Med. Chem., 4, 1059-1077. Scholar google search
Sechi M., Denidas M., Dallocchio R., Dessi A., Bacchi A., Sannia L., Carta E., Palomba M., Ragab O., Chan C., Shoemaker R., Sei S., Dayam R., Neamati N. (2004) J. Med. Chem., 47, 5298-310. Scholar google search
Pais G.C., Zhang X., Marchand C., Neamati N., Cowansage K., Svarovskaia E.S., Pathak V.K., Tang Y., Nicklaus M., Pommier Y., Burke T.R.Jr. (2002) J. Med. Chem., 45, 3184-94. Scholar google search
Hazuda D.J., Felock P., Witmer M., Wolfe A., Stillmock K., Grobler J.A, Espeseth A., Gabryelski L, Schleif W., Blau C., Miller M.D. (2000) Science., 287, 646-650. Scholar google search
Grobler J.A., Stillmock К., Hu В., Witmer M., Felock P., Espeseth A.S., Wolfe A., Egbertson M., Bourgeois M., Melamed J., Wai J.S., Young S., Vacca J., Hazuda D.J. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 99, 6661-6666. Scholar google search
Marchand C., Zhang X., Pais G.C., Cowansage K., Neamati N., Burke T.R.Jr., Pommier Y. (2002) J. Biol. Chera., 277, 12596-12603. Scholar google search
Long Y.Q., JiangX .H., Dayam R., Sanchez Т., Shoemaker R., Sei S., Neamati N. (2004) J. Med. Chem., 47, 2561-2573. Scholar google search
Poroikov V.V., Filimonov D.A. (2002) J. Comput. Aid. Molec. Des., 16, 819-824. Scholar google search
Poroikov V., Filimonov D. (2005) in: Predictive Toxicology (C. Helmaed.) N.Y.: Taylor&Fransis, pp. 459-478. Scholar google search
