1. ГУ НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
Раздел: Экспериментальные/клинические исследование
Год: 2006 том: 52 выпуск: 1 страницы: 3-18
Предложен новый метод для анализа количественных взаимосвязей "структура-активность", основанный на описании химической структуры в виде MNA дескрипторов, классификации веществ обучающей выборки на основе нечетких градаций и самосогласованной регрессии. Метод реализован в компьютерной программе GUSAR (General Unrestricted Structure Activity Relationships). Валидация метода на примере ингибиторов CDK1 показала, что его точность сопоставима с качеством прогноза, обеспечиваемого с применением 3D QSAR методов CoMFA и CoMSIA, однако, в отличие от них, GUSAR не требует данных о пространственной структуре макромолекулы-мишени и соответствующих лигандов. Показана применимость метода GUSAR для анализа взаимосвязей "структура-активность" в гетерогенных выборках, содержащих соединения из различных химических классов.
Захаров А.В. и др. Количественный анализ взаимосвязей "структура-активность" ингибиторов циклин-зависимой киназы 1 // Биомедицинская химия. - 2006. - Т. 52. -N 1. - С. 3-18.
Захаров А.В. и др., "Количественный анализ взаимосвязей "структура-активность" ингибиторов циклин-зависимой киназы 1." Биомедицинская химия 52.1 (2006): 3-18.
Захаров, А. В., Лагунин, А. А., Филимонов, Д. А., Поройков, В. В. (2006). Количественный анализ взаимосвязей "структура-активность" ингибиторов циклин-зависимой киназы 1. Биомедицинская химия, 52(1), 3-18.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750807010039
Wolfel T., Hauer M., Schneider J., Serrano M., Wolfel C., Klehmann H., De Plaen E., Hankeln T., Meyerzum-Buschenfelde K., Beach D (1995) Science, 269, 1281. Scholar google search
Livingstone D. (1995) Data Analysis for Chemists. Applications to QSAR and Chemical Product Design, Oxford University Press. Scholar google search
Kubinyi H. (1995) in: QSAR and Molecular Modelling: Concepts, Computation Tools and Biological Applications (F. Sanz, J. Giraldo, F. Manaut eds.) J.P. Prous Science Publishers, Barcelona, pp. 2-18. Scholar google search
Kubinyi H. (1993) 3D QSAR in Drug Design. Theory Methods and Applications, ESCOM, Leiden. Scholar google search
Leach A. (2001) Molecular Modelling. Principles and applications, Prentice Hall. Scholar google search
Gasteiger J. (2003) Handbook of Chemoinformatics. From Data to Knowledge in 4 Volumes, WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KgaA, Weinheim. Scholar google search
Filimonov D., Poroikov V., Borodina Yu., Gloriozova T. (1999) J. Chem. Inf. Comput. Sci., 39(4), 666-670. CrossRef Scholar google search
Kunick C., Lauenroth K., Wieking K., Xu Xie, Schultz C., Gussio R., Zaharevitz D., Leost M., Meijer L., Weber A., Flemming S., Lemcke T. (2004) J. Med. Chem., 47, 22-36. CrossRef Scholar google search
Kunick C., Zeng Z., Gussio R., Zaharevitz D., Leost M., Totzke F., Schachtele C., Kubbutat M., Meijer L., Thomas L. (2005) ChemBioChem., 6, 1-9. CrossRef Scholar google search
