Препараты бактериальных L-аспарагиназ, катализирующих гидролиз L-аспарагина до L-аспартата и аммиака, используются в практической медицине для лечения острой лимфобластной лейкемии. Длительное терапевтическое применение этих препаратов сопровождается рядом побочных эффектов, обусловленных наличием у фермента глутаминазной активности. Субстратная специфичность и активность L-аспарагиназы напрямую связаны с процессом олигомеризации, поскольку фермент активен только в олигомерной форме (в виде тетрамера), и активные центры расположены в зоне контакта субъединиц. Данная работа посвящена моделированию пространственной структуры L-аспарагиназы Erwinia carotovora на основе гомологии с L-аспарагиназой Erwinia chrysanthemi, сравнительному молекулярно-графическому анализу интерфейса между субъединицами этих ферментов, а также разработке подхода для экспериментального изучения процесса олигомеризации фермента. L-аспарагиназа была иммобилизована на поверхности чипа СМ5 оптического биосенсора Biacore 3000. С помощью метода поверхностного плазмонного резонанса были зарегистрированы процессы распада тетрамерных комплексов фермента до мономерного состояния и последующего их восстановления.
Мезенцев Ю.В. и др. Олигомеризация L-аспарагиназы из Erwinia carotovora // Биомедицинская химия. - 2006. - Т. 52. -N 3. - С. 258-271.
Мезенцев Ю.В. и др., "Олигомеризация L-аспарагиназы из Erwinia carotovora." Биомедицинская химия 52.3 (2006): 258-271.
Мезенцев, Ю. В., Мольнар, А. А., Гнеденко, О. В., Красоткина, Ю. В., Соколов, Н. Н., Иванов, А. С. (2006). Олигомеризация L-аспарагиназы из Erwinia carotovora. Биомедицинская химия, 52(3), 258-271.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S199075080701009X
Список литературы
Aghaiypour K., Wlodawer A., Lubkowski J. (2001) Biochem., 40, 5655-5664. Scholar google search
Kotzia G.A., Labrou N.E. (2005) J. Biotechnology, 119, 309-323. Scholar google search
Howard J.B., Carpenter F.H. (1972) J. Biol. Chem., 247, 1020-1030. Scholar google search
Derst C., Henseling J., Rцhm K.-H. (2000) Protein Science, 9, 2009-2017. Scholar google search
Schwartz J.H., Reevesi J.Y., Broome J.D. (1966) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 56, 1516-1519 . Scholar google search
Muller H.J., Beier R., Loning L., Blutters-Sawatzki R., Dorffel W., Maass E., Muller-Weihrich S., Scheel-Walter H.G., Scherer F., Stahnke K., Schrappe M., Horn A., Lumkemann K., Boos J. (2001) Br. J. Haematol., 114, 794-799. Scholar google search
Lubkowski J., Dauter M., Aghaiypour K., Wlodawera A., Dauter Z. (2003) Acta Cryst., 59, 84-92. Scholar google search
Borek D., Jaskolski M. (2001) Acta Biochim. Pol., 48, 893-902. Scholar google search
Bell K.S., Sebaihia M., Pritchard L., Holden M.T.G., Hyman L.J., Holeva M.C., Thomson N.R., Bentley S.D., Churcher L.J.C., Mungall K., Atkin R., Bason N., Brooks K., Chillingworth T., Clark K., Doggett J., Fraser A., Hance Z., Hauser H., , Toth I.K. (2004) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 11105-11110. Scholar google search
Jonsson U., Fagerstam L., Ivarsson B., Johnsson B., Karlsson R., Lundh K., Lofas S., Persson B., Roos H., Ronnberg I., Sjolander R., Stenberg E., Stahlberg R., Urbaniczky C., Ostlin H., Malmqvist M. (1991) BioTechniques. 11, 620-627. Scholar google search
Кислицын Ю.А., Кравченко О.В., Никонов С.В., Куранова И.П. (2006) Кристаллография, 51. (в печати). Scholar google search