Внедрение результатов протеомных исследований в научную и медицинскую практику будет во многом зависеть от прогресса технологий аффинных микрочипов, что определяет интерес к поиску более дешёвых альтернатив моноклональным антителам как аффинным реагентам. Среди синтетических миметиков антител олигонуклеотидные аптамеры представляют наибольший интерес как аффинные реагенты в силу возможности автоматизации метода их селекции и низкой себестоимости синтеза. В обзоре рассмотрен круг вопросов, связанных с автоматизацией и оптимизацией селекции аптамеров, и с селекцией фотоаптамеров, способных к образованию фотоиндуцированных ковалентных сшивок с белковыми мишенями. Обсуждаются существующие подходы к пост-селекционной модификации аптамеров для повышения их аффинности и селективности к белкам-мишеням.
Радько С.П. и др. Аптамеры как перспективные аффинные реагенты для клинической протеомики // Биомедицинская химия. - 2007. - Т. 53. -N 1. - С. 5-24.
Радько С.П. и др., "Аптамеры как перспективные аффинные реагенты для клинической протеомики." Биомедицинская химия 53.1 (2007): 5-24.
Радько, С. П., Рахметова, С. Ю., Бодоев, Н. В., Арчаков, А. И. (2007). Аптамеры как перспективные аффинные реагенты для клинической протеомики. Биомедицинская химия, 53(1), 5-24.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750807030043
Pan W., Craven R.C., Qiu Q., Wilson C.B., Wills J.W., Golovine S., Wang J.F. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92, 11509-11513. CrossRef Scholar google search
Kohn D.B., Bauer G., Rice C.R., Rothschild J.C., Carbonaro D.A., Valdez P., Hao Q., Zhou C., Bahner I., Kearns K., Brody K., Fox S., Haden E., Wilson K., Salata C., Dolan C., Wetter C., Aguilar-Cordova E., Church J. (1999) Blood, 94, 368-371. Scholar google search
Farokhzad O.C., Cheng J., Teply B.A., Sherifi I., Jon S., Kantoff P.W., Richie J.P., Langer R. (2006) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103, 6315-6320. CrossRef Scholar google search
Stefan R.I., van Staden J.F., Aboul-Enein H.Y. (2000) Fresenius J. Anal. Chem., 366, 659-668. CrossRef Scholar google search
Zhu H., Bilgin M., Bangham R., Hall D., Casamayor A., Bertone P., Lan N., Jansen R., Bidlingmaier S., Houfek T., Mitchell T., Miller P., Dean R.A., Gerstein M., Snyder M. (2001) Science, 293, 2101-2115. CrossRef Scholar google search
Golden M.C., Resing K.A., Collins B.D., Willis M.C., Koch T.H. (1999) Protein Sci., 8, 2806-2812. CrossRef Scholar google search
Wessman J., Stefan R.I., van Staden J.F., Danzer K., Lindner W., Burns D.T., Fajgelj A., Muller H. (2001) Pure Appl. Chem., 73, 1381-1386. Scholar google search
Berezovski M., Drabovich A., Krylova S.M., Musheev M., Okhonin V., Petrov A., Krylov S.N. (2005) J. Am. Chem. Soc., 127, 3165-3171. CrossRef Scholar google search
Yamamoto R., Katahira M., Nishikawa S., Baba T., Taira K., Kumar P.K. (2000) Genes Cells., 5, 371-388. CrossRef Scholar google search
Matsugami A., Kobayashi S., Ouhashi K., Uesugi S., Yamamoto R., Taira K., Nishikawa S., Kumar P.K.R., Katahira M. (2003) Structure, 11, 533-545. CrossRef Scholar google search
Fukuda K., Vishnuvardhan D., Sekiya S., Hwang J., Kakiuchi N., Taira K., Shimotohno K., Kumar P.K., Nishikawa S. (2000) Eur. J. Biochem., 267, 3685-3694. CrossRef Scholar google search