В современной науке техника протеомного анализа находится в неразрывной связи с другими отраслями системной биологии. Обладая широкими возможностями, количественная протеомика оперирует колоссальным массивом данных о молекулярных механизмах, лежащих в основе жизни. Достижения протеомики помогают исследователям решать сложные вопросы клеточной сигнализации, пострансляционных модификаций, структурной и функциональной гомологии белков, молекулярной диагностики. В протеомике было разработано свыше 40 различных методов для осуществления количественного анализа, и, хотя, каждый из них по-своему уникален и обладает рядом преимуществ и недостатков, все их можно объединить под "единым флагом" использования изотопной метки. В обзоре рассмотрены наиболее популярные и самые эффективные современные подходы количественной протеомики, использующие как химические модификации белков, так и метаболические и ферментативные методы включения изотопной метки.
Копылов А.Т., Згода В.Г. (2007) Количественные методы в протеомике. Биомедицинская химия, 53(6), 613-643.
Копылов А.Т. и др. Количественные методы в протеомике // Биомедицинская химия. - 2007. - Т. 53. -N 6. - С. 613-643.
Копылов А.Т. и др., "Количественные методы в протеомике." Биомедицинская химия 53.6 (2007): 613-643.
Копылов, А. Т., Згода, В. Г. (2007). Количественные методы в протеомике. Биомедицинская химия, 53(6), 613-643.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1007/s11828-008-1003-2
Список литературы
Tonge R., Shaw J., Middleton B., Rowlinson R., Rayner S., Young J., Pognan F., Hawkins E., Currie I., Davison M. (2001) Proteomics, 1, 377-396. Scholar google search
Lubman D.M., Kachman M.T., Wang H., Gong S., Yan F., Hamler R.L., O`Neil K.A., Zhu K., Buchanan N.S., Barder T.J. (2002) J. Chromatogr B, ???, 183-196. Scholar google search
Hamler R.L., Zhu K., Buchanani,N.S., Kreunin P., Kachman M.T., Miller F.R., Lubman D.M. (2004) Proteomics, 4, 562-577. Scholar google search
Wang H.X., Kachman M.T., Schwatrz D.R., Cho K.R., Lubman D.M. (2004) Proteomics, 4, 2476-2495. Scholar google search
Opitek G.J., Ramirez S.M., Jorgenson J.W., Moseley M.A. (1998) Anal. Biochem., 258, 349-361. Scholar google search
Chong B.E., Yan F., Lubman D.M., Miller F.R. (2001) Rapid Commun. Mass Spectrom., 15, 291-296. Scholar google search
Zhang Z.L., Smith D.L., Smith J.B. (2001) Proteomics, 1, 1001-1009. Scholar google search
Lubman D.M., Kachman M.T., Wang H., Gong S., Yan F., Hamler R.L., O`Neil K.A., Zhu K., Buchanan N.S., Barder T.J. (2002) J. Chromatogr B, ???, 183-196. Scholar google search
Zhu K., Kachman M.T., Miller F.R., Lubman D.M., Zhang R. (2004) J. Chromatogr. A, 1053, 133-142. Scholar google search
Feng B.B., Patel A.H., Keller P.M., Slemmon J.R. (2001) Rapid Commun. Mass Spectom., 15, 821-826. Scholar google search
Krapfenbauer K., Fountoulakis M., Lubec G. (2003) Electrophoresis, 24, 1847-1870. Scholar google search
El Rassi Z., Horvath C. (1986) J. Chromatogr. B, 359, 255-264. Scholar google search
Gerber S.A., Rush J., Stemman O., Kirschner M.W., Gygi S.P. (2003) Proc. Nat. Acad. Sci. USA, vol. 100, 12, 6940-6945. Scholar google search
Oda Y., Huang K., Cross F.R., Cowburn D., Chait B.T. (1999) Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 96, 6591-6596. Scholar google search
Ranish J.A., Yi E.C., Leslie D.M., Purvine S.O., Goodlet D.R., Eng J., Aebersold R. (2003) Nature Genetics, 18 february published on line; doi:10.1038/ng1101. Scholar google search
Shen M., Guo L., Wallace A., Fitzner J., Eisenman J., Jacobson E., Jhonson R.S. (2003) Mol. Cell. Proteomics, 2, 315-324. Scholar google search
Ficarro S.B., McCleland M.L., Stukenberg P.T., Burke D.J., Ross M.M., Shabanowitz J., Hunt D.F., White F.M. (2002) Nature Biotechnology, 20, 301-305. Scholar google search
Huang C.M., Foster K.W., DeSilva D., Zhang J., Zhi Z., Yusuf N., Van Kampen K.R., Elmets C.A., Tang D.C. (2003) J. Investig. Dermatol., 121, 51-64. Scholar google search
Blonder J., Terunuma A., Conrads T.P., Chan K.C., Yee C., Lucas D.A., Schaefer C.F., Yu L.R., Issaq H.J., Veenstra T.D., Vogel J.C. (2004) J. Investig. Dermatol., 123, 691-699. Scholar google search
Uematsu R., Furukawa J.-I., Nakagawa H., Shinohara Y., Deguchi K., Monde K., Nishimura S.-I. (2005) Mol. Cell. Proteomics, 4, 1977-1989. Scholar google search
Nakagawa H., Kawamura Y., Kato K., Shimada I., Arata Y., Takahashi N. (1995) Anal. Biochem., 226, 130-138. Scholar google search
Takahashi N., Nakagawa H., Fujikawa K., Kawamura Y., Tomiya N. (1995) Anal. Biochem., 226, 139-146. Scholar google search
Yamamoto S., Hase S., Fukuda S., Sano O., Ikenaka T. (1989) J. Biochem., 105, 547-555. Scholar google search
