Кратко изложены основные принципы анализа и оптимизации молекулярной конформации, которые лежат в основе методов молекулярного моделирования, используемых для решения задач в области биоинформатики. Рассмотрены основные подходы в поиске энергетических минимумов модельной молекулярной системы. Данная лекция входит в теоретический цикл "Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств" для студентов 4 курса Медико-биологического факультета РГМУ (специальности - биохимия, биофизика, медицинская кибернетика), может быть также рекомендована для других студентов и аспирантов медико-биологических специальностей.
Leach A.R. (1991) Reviews in Computational Chemistry, 2, 1-55. Scholar google search
Schlick T. (1992) Reviews in Computational Chemistry, 3, 1-71. Scholar google search
Doucet Jean-Pierre, Weber Jacques (1996) Computer-Aided Molecular Design: Theory and Applications, Academic Press, London. Scholar google search
Pettersson I., Liljefors T. (1996) Reviews in Computational Chemistry, 9, 167-189. Scholar google search
Степанов Н.Ф. (2001) Квантовая механика и квантовая химия, Мир, М. Scholar google search
Финкельштейн А.В., Птицын О.Б. (2002) Физика белка: Курс лекций с цветными и стереоскопическими иллюстрациями, Книжный дом `Университет`, М. Scholar google search
Шайтан К.В., Терёшкина К.Б. Молекулярная динамика белков и пептидов. Методическое пособие (http://www.moldyn.ru/library/manual/). Scholar google search
