1. Государственное учреждение Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН 2. Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии РАМН 3. Российский Научный центр хирургии РАМН
Раздел: Экспериментальные/клинические исследование
Проведён сравнительный анализ синтеза мРНК и белков печени 10,5-недельного плода и взрослого человека. Данные о дифференциальной экспрессии генов получены с использованием двухцветной конкурентной гибридизации флуоресцентно меченой кРНК на микрочипах фирмы Agilent, включающих гены полного генома человека. Протеиновые профили получали при помощи двумерного электрофореза клеточных экстрактов в диапазоне pI от 3 до 10. Белки изолировали из гелей и идентифицировали при помощи масс-спектрометрического анализа (MALDI-TOF). Список идентифицированных белков сравнивали со списком генов, преимущественно экспрессируемых в фетальной печени. Объект исследования - фетальная печень - является уникальным органом, поскольку объединяет в себе два типа ткани - собственно печёночную и гемопоэтическую и в течение эмбриогенеза меняет свою основную функциональную активность - с гемопоэтической на начальных стадиях развития на собственно функции метаболизма, детоксификации и секреции различных сывороточных белков. Полученные данные показали, что транскриптомный анализ вполне адекватно отражает основную функцию печени на раннем этапе эмбриогенеза. Были идентифицированы гемоглобины как эмбрионального, так и взрослого типа. Результаты протеомного анализа по большей части подтверждены на уровне анализа мРНК, однако одновременно установлено, что часть высокоэкспрессируемых генов при помощи двумерного электрофореза не выявляется.
Курбатов Л.К., Чеглаков И.Б., Ярыгин К.Н., Сухих Г.Т., Вартанян Г.В., Торопыгин И.Ю., Арчаков А.И. (2008) Сравнительный протеомный и транскриптомный анализ фетальной печени человека. Биомедицинская химия, 54(2), 140-153.
Курбатов Л.К. и др. Сравнительный протеомный и транскриптомный анализ фетальной печени человека // Биомедицинская химия. - 2008. - Т. 54. -N 2. - С. 140-153.
Курбатов Л.К. и др., "Сравнительный протеомный и транскриптомный анализ фетальной печени человека." Биомедицинская химия 54.2 (2008): 140-153.
Курбатов, Л. К., Чеглаков, И. Б., Ярыгин, К. Н., Сухих, Г. Т., Вартанян, Г. В., Торопыгин, И. Ю., Арчаков, А. И. (2008). Сравнительный протеомный и транскриптомный анализ фетальной печени человека. Биомедицинская химия, 54(2), 140-153.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750808030025
Ying W., Jiang Y., Guo L., Hao Y., Zhang Y., Wu S., Zhong F., Wang J., Shi R., Li D., Wan P., Li X., Wei H., Li J., Wang Z., Xue X., Cai Y., Zhu Y., Qian X., He F. (2006) Molecular & Cellular Proteomics, 5.9, 1703-1707. Scholar google search
Choi S.S., Yun J.W., Choi E.K., Cho Y.G., Sung Y.C., and Shin H.-S. (1995) Mamm. Genome, 6, 653-657. Scholar google search
Yu Y., Zhang C., Zhou G., Wu S., Qu X., Wei H., Xing G., Dong C., Zhai Y., Wan J., Ouyang S., Li L., Zhang S., Zhou K., Zhang Y., Wu C., He F. (2001) Genome Res., 11, 1392-1403. Scholar google search
Seliskar M., Rozman D. (2007) Biochim. Biophys. Acta, 1770, 458-466. Scholar google search
Fukami M., Horikawa R., Nagai T., Tanaka T., Naiki Y., Sato N., Okuyama T., Nakai H., Soneda S., Tachibana K., Matsuo N., Sato S., Homma K., Nishimura G., Hasegawa T., Ogata T. (2005) J. Clin. Endocrinol. Metab., 90(1), 414-426. Scholar google search
Pezzi V., Mathis J.M., Rainey W.E., Carr B.R. (2003) J. Steroid Biochem. Mol. Biol., 87(2-3), 181-189. Scholar google search
Capdevila J., Chacos N., Werringloer J., Prough R.A.,. Estabrook R.W. (1981) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 78 (9), 5362-5366. Scholar google search
McCarver D.G., Hines R.N. (2001) J. Pharmacol. Exp. Ther., 300, 361-366. Scholar google search
Hines R.N., McCarver D.G. (2001) J. Pharmacol. Exp. Ther., 300, 355-360. Scholar google search
