Определение "аминокислотных конфликтов" и аминокислотных замен в первичных структурах 41 белка человека протеомными технологиями

Ковалева М.А.; Ковалев Л.И.; Еремина Л.С.; Макаров А.А.; Буракова М.В.; Торопыгин И.Ю.; Серебрякова М.В.; Шишкин С.С.; Арчаков А.И.

Определение "аминокислотных конфликтов" и аминокислотных замен в первичных структурах 41 белка человека протеомными технологиями

Ковалева М.А.¹, Ковалев Л.И.¹, Еремина Л.С.¹, Макаров А.А.¹, Буракова М.В.¹, Торопыгин И.Ю.², Серебрякова М.В.³, Шишкин С.С.¹, Арчаков А.И.²

1. Институт биохимии им. А.Н. Баха Российской академии наук
2. ГУ НИИ биомедицинской химии РАМН им. В.Н.Ореховича
3. НИИ физико-химической медицины МЗ РФ

Раздел: Экспериментальные/клинические исследование

Идентификатор PubMed: 18988458

Год: 2008 том: 54 выпуск: 4 страницы: 420-434

При протеомных исследованиях некоторых тканей и органов человека (скелетные мышцы, миометрий, кора мозга, простата), а также культивируемых миобластов среди идентифицированных белков удалось выявить 41 белок, в аминокислотных последовательностях которых показано присутствие определенных (вариантов) аминокислотных остатков в зарегистрированных "конфликтных" участках. Среди 93 охарактеризованных "аминокислотных конфликтов" семь случаев оказались проявлениями белкового полиморфизма, обусловленного соответствующей единичной аминокислотной заменой. Кроме того, при протеомном анализе белков простаты были идентифицированы две изоформы простат-специфического антигена, которые образуются за счет альтернативного сплайсинга. Таким образом, показано, что с помощью протеомного анализа удается характеризовать разные виды биохимического полиморфизма у многих белков человека.

Загрузить PDF:

Ключевые слова: протеомика, белки человека, аминокислотные конфликты

Цитирование:

Ковалева, М. А., Ковалев, Л. И., Еремина, Л. С., Макаров, А. А., Буракова, М. В., Торопыгин, И. Ю., Серебрякова, М. В., Шишкин, С. С., Арчаков, А. И. (2008). Определение "аминокислотных конфликтов" и аминокислотных замен в первичных структурах 41 белка человека протеомными технологиями. Биомедицинская химия, 54(4), 420-434.

Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»: 10.1134/S199075080804001X

Список литературы

Reijneveld J.C., Ginjaar I.B., Frankhuizen W.S., Notermans N.C. (2006) Muscle Nerve, 34, 656-658. Scholar google search
Kovacs P., Stumvoll M., Bogardus C., Hanson R.L., Baier L.J. (2006) Diabetes, 55, 1497-1503. Scholar google search
Mattarucchi E., Marsoni M., Binelli G., Passi A., Lo Curto F., Pasquali F., Porta G. (2005) J. Biochem. Mol. Biol., 38, 555-562. Scholar google search
Watt K.W.K., Lee P.J., M`Timkulu T., Chan W.P., Loor R. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 83, 3166-3170. Scholar google search
Schulz P., Stucka R., Feldmann H., Combriato G., Klobeck H.-G., Fittler F. (1988) Nucleic Acids Res., 16, 6226. Scholar google search
Говорун В.М., Арчаков А.И. (2002) Биохимия, 67, 1341-1359. Scholar google search
Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Ковалев П.Л., Серебрякова М.В., Мошковский. С.А., Шишкин C.C. (2006) Биохимия, 71, 554-560 . Scholar google search
Крохина Т.Б, Шишкин С.С., Раевская Г.Б., Ковалев Л.И., Ершова Е.С., Черников В.Г., Мирочник В.В., Бубнова Е.Н., Кухаренко В.И. (1996) Бюлл. эксп. биол. мед., 122, 314-317. Scholar google search
Kovalyov L.I., Shishkin S.S., Efimochkin A.S., Kovalyova M.A., Ershova E.S., Egorov T.A., Musalyamov A.K. (1995) Electrophoresis, 16, 1160-1169. CrossRef Scholar google search
Shevchenko A., Wilm M., Vorm O., Mann M. (1996) Anal. Chem., 68, 850-858. CrossRef Scholar google search
Говорун В.М., Мошковский С.А., Тихонова О.В., Гоуфман Е.И., Серебрякова М.В., Момыналиев К.Т., Лохов П.Г., Хряпова Е.В., Кудрявцева Л.В., Смирнова О.В., Торопыгин И.Ю., Максимов Б.И., Арчаков А.И. (2003) Биохимия, 68, 52-60. Scholar google search
Шишкин С.С., Ковалев Л.И., Крахмалева И.Н., Ковалева М.А., Еремина Л.С., Попов В.О. (2007) В кн.: Молекулярный полиморфизм человека.Под. ред. С.Д. Варфоломеева. М. Из-во РУДН. т. 2. 483-539. Scholar google search
Niemann M.A., Baggott J.E., Miller E.J. (1997) Biochim. Biophys. Acta, 1340, 123-130. Scholar google search
Heuze-Vourc`h N., Leblond V., Courty Y. (2003) Eur. J. Biochem., 270, 706-714. Scholar google search

2024 (том 70)
2023 (том 69)
2022 (том 68)
2021 (том 67)
2020 (том 66)
2019 (том 65)
2018 (том 64)
2017 (том 63)
2016 (том 62)
2015 (том 61)
2014 (том 60)
2013 (том 59)
2012 (том 58)
2011 (том 57)
2010 (том 56)
2009 (том 55)
2008 (том 54)

Выпуск 6
Выпуск 5
Выпуск 4
Выпуск 3
Выпуск 2
Выпуск 1

2007 (том 53)
2006 (том 52)
2005 (том 51)
2004 (том 50)
2003 (том 49)

◄ ►