Предсказание взаимосвязанных белков методамисравнительной геномики in silico

   
Пятницкий М.А.1 , Лисица А.В.1, Арчаков А.И.1

1. НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
Раздел: Экспериментальное/клиническое исследование
Идентификатор PubMed: 19662999
Год: 2009  том: 55  выпуск: 3  страницы: 230-246
Обзор посвящен компьютерному поиску взаимосвязанных белков методами сравнительной геномики. Возрастающие возможности биотехнологий по секвенированию новых геномов привели к накоплению данных о последовательностях миллионов генов. Функции большинства этих генов неизвестны, и только для малой части кодируемых ими белков функция может быть определена в эксперименте. Возникает потребность в надежных и достоверных алгоритмах предсказания функций (аннотации) белков методами in silico. В обзоре описаны основные подходы сравнительной геномики, использующие как традиционный способ переноса функций на основании гомологии последовательностей, так и с использованием контекстных свойств генов (методы филогенетических профилей и метод генов-соседей). Применение современных методов сравнительной геномики позволяет получить корректные функциональные аннотации для более чем половины всех белков протеома.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: взаимосвязанные белки, белок-белковые взаимодействия, функциональная аннотация, филогенетические профили, сравнительная геномика
Цитирование:

Пятницкий, М. А., Лисица, А. В., Арчаков, А. И. (2009). Предсказание взаимосвязанных белков методамисравнительной геномики in silico. Биомедицинская химия, 55(3), 230-246.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750809040015
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)