Ингибиторы белок-белковых взаимодействий рассматриваются в настоящее время как перспективные прототипы лекарств нового поколения. Наиболее эффективными мишенями для действия таких ингибиторов являются олигомерные ферменты, в которых активные центры сформированы аминокислотными остатками различных субъединиц. Классическим примером является протеаза ВИЧ-1 (пВИЧ), функционирующая только в виде гомодимера. Нами был разработан подход для скрининга ингибиторов димеризации пВИЧ. Была разработана оригинальная биосенсорная тест-система на основе дифференциального анализа взаимодействия тестируемого вещества с димерами и мономерами пВИЧ. С её помощью был выполнен анализ наиболее перспективных веществ-кандидатов, предсказанных ранее методом виртуального скрининга, а также ряда производных глицирризина, тритерпеновых и стероидных гликозидов. В результате было найдено одно соединение, взаимодействующее преимущественно с мономерами пВИЧ и ингибирующее in vitro ферментативную активность с IC50 порядка 10-6 М.
Ершов П.В., Гнеденко О.В., Мольнар А.А., Лисица А.В., Иванов А.С., Арчаков А.И. (2009) Биосенсорный анализ взаимодействия потенциальных ингибиторов димеризации с протеазой ВИЧ-1. Биомедицинская химия, 55(4), 462-478.
Ершов П.В. и др. Биосенсорный анализ взаимодействия потенциальных ингибиторов димеризации с протеазой ВИЧ-1 // Биомедицинская химия. - 2009. - Т. 55. -N 4. - С. 462-478.
Ершов П.В. и др., "Биосенсорный анализ взаимодействия потенциальных ингибиторов димеризации с протеазой ВИЧ-1." Биомедицинская химия 55.4 (2009): 462-478.
Ершов, П. В., Гнеденко, О. В., Мольнар, А. А., Лисица, А. В., Иванов, А. С., Арчаков, А. И. (2009). Биосенсорный анализ взаимодействия потенциальных ингибиторов димеризации с протеазой ВИЧ-1. Биомедицинская химия, 55(4), 462-478.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S199075080903007X
Список литературы
Veselovsky A.V., Ivanov Y.D., Ivanov A.S., Archakov A.I., Lewi P., Janssen P. (2002) J. Mol. Recognit., 15, 405-422. CrossRef Scholar google search
Ala P.J., Huston E.E., Klabe R.M., McCabe D.D., Duke J.L., Rizzo C.J., Korant B.D., DeLoskey R.J., Lam P.Y., Hodge C.N., Chang C.H. (1997) Biochemistry, 36, 1573-1580. Scholar google search
Roridguez-Barrios F., Gago F. (2004) Current Topics in Medicinal Chemistry, 4, 671-686. Scholar google search
Koh Y., Matsumi S., Das D., Amano M., Davis D.A., Li J., Leschenko S., Baldridge A., Shioda T., Yarchoan R., Ghosh A.K., Mitsuya H. (2007) J. Biol. Chem., 282, 28709-28720. Scholar google search
Boggetto N., Reboud-Ravaux M. (2002) Biol. Chem., 383(9), 1321-1324. Scholar google search
Veselovsky A.V., Ivanov A.S. (2003) Current Drug Targets - Infectious Disorders, 3, 33-40 . Scholar google search
Ito M., Nakashima H., Baba M., Pauwels R., De Clercq E., Shigeta S., Yamamoto N. (1987) Antiviral Research, 7(3), 127-137. Scholar google search
Nakashima H., Matsui T., Yoshida O., Isowa Y., Kido Y., Motoki Y., Ito M., Shigeta S., Mori T., Yamamoto N. (1987) Japanese J. Cancer Res., 78, 767-771. Scholar google search
Ito M., Sato A., Hirabayashi K., Tanabe F., Shigeta S., Baba M., De Clercq E., Nakashima H., Yamamoto N. (1988) Antiviral Res., 10(6), 289-298. Scholar google search
Asl M.N., Hosseinzadeh H. (2008) Phytotherapy Research, 22(6), 709-724. Scholar google search
