Компьютерный поиск и оптимизация новых ингибиторов интегразы вируса иммунодефицита человека

   
Дружиловский Д.С.1 , Филимонов Д.А.1, Лиао Ч.2, Пич М.2, Никлаус М.2, Поройков В.В.1

1. Лаборатория структурно-функционального конструирования лекарств, Учреждение Российской академии медицинских наук Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича РАМН
2. Национальный институт рака, Национальный институт здоровья
Раздел: Экспериментальное/клиническое исследование
Идентификатор PubMed: 20017388
Год: 2009  том: 55  выпуск: 5  страницы: 544-557
Поиск и оптимизация новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1 является актуальной задачей, вследствие имеющих место недостатков существующих лекарств для терапии ВИЧ/СПИД, обусловленных наличием побочных эффектов, высокой стоимостью лечения и возникновением резистентности. В работе продемонстрирована перспективность применения компьютерных методов для поиска и оптимизации ингибиторов реакции 3'-процессинга, осуществляемой интегразой ВИЧ-1. Показана возможность применения специализированной версии компьютерной программы PASS для поиска среди коммерчески доступных образцов химических соединений оригинальных ингибиторов реакции 3'-процессинга, принадлежащих к новому химическому классу. Сравнение общих фармакологических профилей, рассчитанных с помощью PASS для выборки оригинальных ингибиторов интегразы и выборки ингибиторов, известных из литературы, показало, что прогнозируемая селективность оригинальных соединений в среднем сопоставима с селективностью известных ингибиторов, а вероятность проявления побочных/токсических эффектов ниже у оригинальных веществ. Отличия фармакологических профилей оригинальных соединений от известных из литературы ингибиторов 3'-процессинга указывают на существенную новизну веществ изучаемого нами химического класса. Анализ расчетных параметров QikProp, характеризующих ADME свойства молекул, показал, что для оригинальных соединений имеют место значительно меньшие отклонения от диапазона рекомендуемых значений по сравнению с параметрами для ингибиторов интегразы, известных из литературы. Сделан вывод о более высокой перспективности изучаемых нами оригинальных веществ по сравнению с известными из литературы ингибиторами 3'-процессинга.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: интеграза ВИЧ-1, поиск и оптимизация, компьютерные оценки, PASS, QikProp
Цитирование:

Дружиловский, Д. С., Филимонов, Д. А., Лиао, Ч., Пич, М., Никлаус, М., Поройков, В. В. (2009). Компьютерный поиск и оптимизация новых ингибиторов интегразы вируса иммунодефицита человека. Биомедицинская химия, 55(5), 544-557.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750810010087
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)