Сравнительный термодинамический анализ взаимодействия тромбина с антитромбиновыми аптамерами и их гетеродимерной конструкцией

   
Рахметова С.Ю.1, Радько С.П.1 , Гнеденко О.В.1, Бодоев Н.В.1, Иванов А.С.1, Арчаков А.И.1

1. Учреждение Российской академии медицинских наук научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
Раздел: Краткое сообщение
DOI: 10.18097/pbmc20105603404      УДК: 577.113.6      Идентификатор PubMed: 20695220
Год: 2010  том: 56  выпуск: 3  страницы: 404-411
Аптамеры, селективно взаимодействующие с анион-связывающими экзосайтами 1 и 2 тромбина, объединяли в димерные олигонуклеотидные конструкции с помощью поли-(dT)-линкера длиной 35 нуклеотидов. Образование комплексов тромбина с аптамерами и их гетеро- и гомодимерными конструкциями измеряли на оптическом биосенсоре Biacore-3000. Значения KD, полученные для гетеро- и гомодимерных конструкций были соответственно в 25-30 раз и 2-3 раза ниже значений KD для исходных аптамеров. Анализ температурных зависимостей KD в интервале 10°С-40°С показал, что аффинность увеличивается с понижением температуры. При этом изменение энтальпии ΔH при образовании комплексов тромбина с аптамерами и гетеродимерной конструкцией было практически одинаково. Значение изменения энтропии ΔS при образовании комплекса тромбина с гетеродимерной конструкцией было в 1,5-2 раза выше, чем значение ΔS для комплексов с аптамерами. При возрастании температуры с 10°С до 37°С скорости как образования, так и распада комплексов увеличивались. При этом скорость диссоциации комплекса тромбин с гетеродимерной конструкцией была заметно ниже, чем для комплексов с аптамерами, при обеих температурах.
Загрузить PDF:
Ссылка:

Рахметова С.Ю., Радько С.П., Гнеденко О.В., Бодоев Н.В., Иванов А.С., Арчаков А.И. (2010) Биомедицинская химия, 56(3), 404-411.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750811020144
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)