Аптамеры, селективно взаимодействующие с анион-связывающими экзосайтами 1 и 2 тромбина, объединяли в димерные олигонуклеотидные конструкции с помощью поли-(dT)-линкера длиной 35 нуклеотидов. Образование комплексов тромбина с аптамерами и их гетеро- и гомодимерными конструкциями измеряли на оптическом биосенсоре Biacore-3000. Значения KD, полученные для гетеро- и гомодимерных конструкций были соответственно в 25-30 раз и 2-3 раза ниже значений KD для исходных аптамеров. Анализ температурных зависимостей KD в интервале 10°С-40°С показал, что аффинность увеличивается с понижением температуры. При этом изменение энтальпии ΔH при образовании комплексов тромбина с аптамерами и гетеродимерной конструкцией было практически одинаково. Значение изменения энтропии ΔS при образовании комплекса тромбина с гетеродимерной конструкцией было в 1,5-2 раза выше, чем значение ΔS для комплексов с аптамерами. При возрастании температуры с 10°С до 37°С скорости как образования, так и распада комплексов увеличивались. При этом скорость диссоциации комплекса тромбин с гетеродимерной конструкцией была заметно ниже, чем для комплексов с аптамерами, при обеих температурах.
Рахметова С.Ю., Радько С.П., Гнеденко О.В., Бодоев Н.В., Иванов А.С., Арчаков А.И. (2010) Сравнительный термодинамический анализ взаимодействия тромбина с антитромбиновыми аптамерами и их гетеродимерной конструкцией. Биомедицинская химия, 56(3), 404-411.
Рахметова С.Ю. и др. Сравнительный термодинамический анализ взаимодействия тромбина с антитромбиновыми аптамерами и их гетеродимерной конструкцией // Биомедицинская химия. - 2010. - Т. 56. -N 3. - С. 404-411.
Рахметова С.Ю. и др., "Сравнительный термодинамический анализ взаимодействия тромбина с антитромбиновыми аптамерами и их гетеродимерной конструкцией." Биомедицинская химия 56.3 (2010): 404-411.
Рахметова, С. Ю., Радько, С. П., Гнеденко, О. В., Бодоев, Н. В., Иванов, А. С., Арчаков, А. И. (2010). Сравнительный термодинамический анализ взаимодействия тромбина с антитромбиновыми аптамерами и их гетеродимерной конструкцией. Биомедицинская химия, 56(3), 404-411.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750811020144
