Рассмотрены многочисленные данные о получении и свойствах новых молекулярных узнающих элементов - ДНК-/РНК-аптамерах. Основное внимание обращено на аптамеры к белкам, играющим центральную роль в распространенных заболеваниях человека. Обобщены данные об аптамерах к сериновым протеиназам, цитокинам, к белкам вируса гриппа, к белкам вируса иммунодефицита. Высокое сродство и специфичность связывания аптамеров с данными белками делает их привлекательными в качестве прямых ингибиторов белков. Аптамеры могут регулировать активность патогенных белков, и как показывают представленные данные, эта идея перешла из стадии фундаментальных исследований в плоскость решения практических задач.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: ДНК-/РНК-аптамеры, белки, метод SELEX
Цитирование:
Спиридонова В.А. (2010) Молекулярные узнающие элементы - ДНК-/РНК-аптамеры к белкам. Биомедицинская химия, 56(6), 639-656.
и др. Молекулярные узнающие элементы - ДНК-/РНК-аптамеры к белкам // Биомедицинская химия. - 2010. - Т. 56. -N 6. - С. 639-656.
и др., "Молекулярные узнающие элементы - ДНК-/РНК-аптамеры к белкам." Биомедицинская химия 56.6 (2010): 639-656.
Спиридонова, В. А. (2010). Молекулярные узнающие элементы - ДНК-/РНК-аптамеры к белкам. Биомедицинская химия, 56(6), 639-656.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750810020046
Pagratis N.C., Bell C., Chang Y.F., Jennings S., Fitzwater T., Jellinek D., Dang C. (1997) Nat. Biotechnol., 15, 68-73. CrossRef Scholar google search
Green L.S., Jellinek D., Bell C., Beebe L.A., Feistner B.D., Gill S.C., Jucker F.M., Janjic N. (1995) Chem. Biol., 2, 683-695. CrossRef Scholar google search
Jellinek D., Green L.S., Bel C., Lynott C.K., Gill N., Vargeese C., Kirschenheuter G., McGee D.P., Abesinghe P., Pieken W.A. (1995) Biochemistry, 34, 11363-11372. CrossRef Scholar google search
Willis M.C., Collins B.D., Zhang T., Green L.S., Sebesta D.P., Bell C., Kellogg E., Gill S.C., Magallanez A., Knauer S., Bendele R.A., Gill P.S., Janjic N. (1998) Bioconjug. Chem., 9, 573-582. CrossRef Scholar google search
Aurup H., Siebert A., Benseler F., Williams D., Eckstein F. (1994) Nucleic Acids Res., 22, 4963-4968. CrossRef Scholar google search
Beigelman L., McSwiggen J.A., Draper K.G., Gonzalez C., Jensen K., Karpeisky A.M., Modak A.S., Matulic-Adamic J., DiRenzo A.B., Haeberli P. (1995) J. Biol. Chem., 270, 25702-25708. CrossRef Scholar google search
Tucker C.E., Chen L.S., Judkins M.B., Farmer J.A., Gill S.C., Drolet D.W. (1999) J. Chromatogr. B Biomed. Sci. Appl., 732, 203-212. CrossRef Scholar google search
White R., Rusconi C., Scardino E., Wolberg A., Lawson J., Hoffman M., Sullenger B. (2001) Mol. Ther., 4, 567-573. CrossRef Scholar google search
Rusconi C.P., Roberts J.D., Pitoc G.A., Nimjee S.M., White R.R., Quick G.Jr., Scardino E., Fay W.P., Sullenger B.A. (2004) Nat. Biotechnol., 22, 1423-1428. CrossRef Scholar google search
Панченко Е.П., Добровольский А.Б. (1999) В кн. Тромбозы в кардиологии. Механизмы развития и возможности терапии, Изд. `Спорт и культура`, М., с. 55-74. Scholar google search
Kumar P.K., Machida K., Urvil P.T., Kakiuchi N., Vishnuvardhan D., Shimotohno K., Taira K., Nishikawa S. (1997) Virology, 237, 270-282. CrossRef Scholar google search
Fukuda K., Vishnuvardhan D., Sekiya S., Hwang J., Kakiuchi N., Taira K., Shimotohno K., Kumar P.K., Nishikawa S. (2000) Eur. J. Biochem., 267, 3685-3694. CrossRef Scholar google search
Hwang J., Fauzi H., Fukuda K., Sekiya S., Kakiuchi N., Shimotohno K., Taira K., Kusakabe I., Nishikawa S. (2000) Biochem. Biophys. Res. Commun., 279,557-562. CrossRef Scholar google search
Smith D., Kirschenheuter G.P., Charlton J., Guidot D.M., Repine J.E. (1995) Chem. Biol., 2, 741-750. CrossRef Scholar google search
Ruckman J., Green L.S., Beeson J., Waugh S., Gillette W.L., Henninger D.D., Claesson-Welsh L., Janjic N. (1998) J. Biol. Chem., 273, 20556-20567. CrossRef Scholar google search
Gragoudas E.S., Adamis A.P., Cunningham E.T. Jr., Feinsod M., Guyer D.R. (2004) N Engl. J. Med., 351, 2805-2816. CrossRef Scholar google search
Huang J., Moore J., Soffer S., Kim E., Rowe D., Manley C.A., O`Toole K., Middlesworth W., Stolar C., Yamashiro D., Kandel J. (2001) J. Pediatr. Surg., 36, 357-361. CrossRef Scholar google search
Ройт А., Бростофф Дж., Мейл Д., В кн. `Иммунология`, М, `Мир`, 2000, с. 210. Scholar google search
Jellinek D., Lynott C.K., Rifkin D.B., Janjic N. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 11227-11231. CrossRef Scholar google search
Green L.S., Jellinek D., Jenison R., Ostman A., Heldin C.H., Janjic N. (1996) Biochemistry, 35, 14413-14424. CrossRef Scholar google search
Floege J., Ostendorf T., Janssen U., Burg M., Radeke H.H., Vargeese C., Gil S.C., Green L.S., Janjic N. (1999) Am. J. Pathol., 154, 169-179. CrossRef Scholar google search
Kubik M.F., Bell C., Fitzwater T., Watson S.R., Tasset D.M (1997) J. Immunol., 159, 259-267. Scholar google search
White R.R., Shan S., Rusconi C.P., Shetty G., Dewhirst M.W., Kontos C.D., Sullenger B.A. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100, 5028-5033. CrossRef Scholar google search
Bohjanen P.R., Colvin R.A., Puttaraju M., Been M.D., Garcia-Blanco M.A. (1996) Nucleic Acids Res., 24, 3733-3738. CrossRef Scholar google search
Sullenger B.A., Gallardo H.F., Ungers G.E., Gilboa E. (1991) J. Virol., 65, 6811-6816. Scholar google search
Yamamoto R., Katahira M., Nishikawa S., Baba T., Taira K., Kumar P.K. (2000) Genes Cells, 5, 371-388. CrossRef Scholar google search
Matsugami A., Tamura Y., Kudo M., Uesugi S., Yamamoto R., Kumar P., Katahira M. (2004) Nucleic Acids Symp. Ser. (Oxf), 48, 111-112. CrossRef Scholar google search
Lisziewicz J., Sun D., Smythe J., Lusso P., Lori F., Louie A., Markham P., Rossi J., Reitz M., Gallo R.C. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 8000-8004. CrossRef Scholar google search
Browning C.M., Cagnon L., Good P.D., Rossi J., Engelke D.R., Markovitz D.M. (1999) J. Virol., 73, 5191-5195. Scholar google search
Bahner I., Kearns K., Hao Q.L., Smogorzewska E.M., Kohn D.B. (1996) J. Virol., 70, 4352-4360. Scholar google search
Kohn D.B., Bauer G., Rice C.R., Rothschild J.C., Carbonaro D.A., Valdez P., Hao Q., Zhou C., Bahner I., Kearns K., Brody K., Fox S., Haden E., Wilson K., Salata C., Dolan C., Wetter C., Aguilar-Cordova E., Church J. (1999) Blood, 94, 368-371. Scholar google search
Morishita R., Gibbons G.H., Horiuchi M., Ellison K.E., Nakama M., Zhang L., Kaneda Y., Ogihara T., Dzau V.J. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92, 5855-5859. CrossRef Scholar google search
Verma I.M., Stevenson J.K., Schwarz E.M., Van Antwerp D., Miyamoto S. (1995) Genes Dev., 9, 2723-2735. CrossRef Scholar google search
Morishita R., Sugimoto T., Aoki M., Kida I., Tomita N., Moriguchi A., Maeda K., Sawa Y., Kaneda Y., Higaki J., Ogihara T. (1997) Nat. Med., 3, 894-899. CrossRef Scholar google search
Sawa Y., Morishita R., Suzuki K., Kagisaki K., Kaneda Y., Maeda K., Kadoba K., Matsuda H. (1997) Circulation, 96, 280-284. Scholar google search
Tomita N., Morishita R., Tomita S., Gibbons G.H., Zhang L., Horiuchi M., Kaneda Y., Higaki J., Ogihara T., Dzau V.J. (2000) Gene Ther., 7, 1326-1332. CrossRef Scholar google search