Компьютерное моделирование потенциальных ингибиторов репликации вич-1 подтипа а как основа для рационального дизайна эффективных противовирусных препаратов
Андрианов А.М.1 , Анищенко И.В.2
1. Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси 2. Объединённый институт проблем информатики Национальной академии наук Беларуси
Раздел: Экспериментальные/клинические исследование
Методами молекулярного докинга построена модель структурного комплекса одного из представителей семейства иммунофилинов - циклофилина B, с петлей V3 ВИЧ-1 подтипа А - участком белка gp120 вируса, формирующим его основную антигенную детерминанту, а также детерминанты, ответственные за клеточный тропизм и образование синцития. Исходя из конформационных и энергетических характеристик комплекса, осуществлен компьютерный дизайн полипептида, способного к эффективной блокаде функционально значимых участков петли V3 ВИЧ-1. На основе совместного анализа полученных результатов и данных литературы высказано предположение о том, что сконструированная молекула представляет перспективную фармакологическую субстанцию антивирусного действия и может быть использована в качестве базовой структуры для реализации белково-инженерных проектов, ориентированных на создание эффективных лекарственных препаратов для терапии СПИДа.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: вирус иммунодефицита человека типа 1, белок gp120, петля V3, циклофилин B, компьютерное моделирование, молекулярный докинг, лекарственные препараты
Цитирование:
Андрианов А.М., Анищенко И.В. (2011) Компьютерное моделирование потенциальных ингибиторов репликации вич-1 подтипа а как основа для рационального дизайна эффективных противовирусных препаратов. Биомедицинская химия, 57(2), 161-173.
Андрианов А.М. и др. Компьютерное моделирование потенциальных ингибиторов репликации вич-1 подтипа а как основа для рационального дизайна эффективных противовирусных препаратов // Биомедицинская химия. - 2011. - Т. 57. -N 2. - С. 161-173.
Андрианов А.М. и др., "Компьютерное моделирование потенциальных ингибиторов репликации вич-1 подтипа а как основа для рационального дизайна эффективных противовирусных препаратов." Биомедицинская химия 57.2 (2011): 161-173.
Андрианов, А. М., Анищенко, И. В. (2011). Компьютерное моделирование потенциальных ингибиторов репликации вич-1 подтипа а как основа для рационального дизайна эффективных противовирусных препаратов. Биомедицинская химия, 57(2), 161-173.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750810040037
Список литературы
Hartley O., Klasse P.J., Sattentau Q.J., Moore J.P. (2005) AIDS Res. Hum. Retroviruses, 21, 171-189. CrossRef Scholar google search
Kartikeyan S., Bharmal R.N., Tiwari R.P., Bisen P.S. (2007) HIV and AIDS: Basic Elements and Priorities, Springer: Netherlands, p. 428. CrossRef Scholar google search