Проведён кинетический и термодинамический анализ взаимодействия пептидного и непептидного ингибиторов димеризации с иммобилизованными на оптическом чипе мономерами протеазы ВИЧ (пВИЧ) методом поверхностного плазмонного резонанса. Молекулярные взаимодействия исследовали при разных концентрациях ингибиторов (0-80 мкM) и температурах (15-35°C). Определение кинетических (kon, koff) и равновесных (KD) констант, а также термодинамических параметров взаимодействия (ΔG, ΔH, -ТΔS) показало, что оба ингибитора характеризуются близкими параметрами и основной движущей силой образования комплексов с мономерами пВИЧ является энтропийная компонента (-ТΔS), значение которой в среднем составляет порядка -20 ккал/моль, тогда как энтальпийная компонента (ΔH) положительна (14 ккал/моль) и противодействует образованию комплексов.
Ершов П.В., Гнеденко О.В., Мольнар А.А., Лисица А.В., Иванов А.С., Арчаков А.И. (2012) Кинетический и термодинамический анализ взаимодействия ингибиторов димеризации с мономерами протеазы вич методом поверхностного плазмонного резонанса. Биомедицинская химия, 58(1), 43-49.
Ершов П.В. и др. Кинетический и термодинамический анализ взаимодействия ингибиторов димеризации с мономерами протеазы вич методом поверхностного плазмонного резонанса // Биомедицинская химия. - 2012. - Т. 58. -N 1. - С. 43-49.
Ершов П.В. и др., "Кинетический и термодинамический анализ взаимодействия ингибиторов димеризации с мономерами протеазы вич методом поверхностного плазмонного резонанса." Биомедицинская химия 58.1 (2012): 43-49.
Ершов, П. В., Гнеденко, О. В., Мольнар, А. А., Лисица, А. В., Иванов, А. С., Арчаков, А. И. (2012). Кинетический и термодинамический анализ взаимодействия ингибиторов димеризации с мономерами протеазы вич методом поверхностного плазмонного резонанса. Биомедицинская химия, 58(1), 43-49.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750812010039
Список литературы
Anderson J., Schiffer C., Lee S.K., Swanstrom R. (2009) Handbook Exp. Pharmacol., 189, 85-110. CrossRef Scholar google search
Mastrolorenzo A., Rusconi S., Scozzafava A., Barbaro G., Supuran C.T. (2007) Curr. Med. Chem., 14, 2734-2748. CrossRef Scholar google search
Muzammil S., Armstrong A.A., Kang L.W., Jakalian A., Bonneau P.R., Schmelmer V., Amzel L. M., Freire E. (2007) J. Vir., 81, 5144-5154. Scholar google search
Markgren P-O., Lindgren M.T., Gertow K., Karlsson R., Hamalainen M., Danielson U.H. (2001) Anal. Biochem., 291, 207-218. CrossRef Scholar google search
Zutshi R., Franciskovich J., Shultz M., Schweitzer B., Bishop P., Wilson M., Chmielewshi J. (1997) J. Am. Chem. Soc., 119, 4841-4845. CrossRef Scholar google search
