Компьютерные классификационные модели взаимосвязи структуры химических соединений и лекарств с их способностью проникать через гематоэнцефалический барьер
Способность лекарственных веществ проходить через гематоэнцефалический барьер (ГЭБ), обозначенная как ВВВ+ и ВВВ для не проникающих ГЭБ, является одним из важнейших свойств соединений, действующих на центральную нервную систему (ЦНС). В работе представлены результаты по моделированию взаимосвязи структуры органических лекарственных препаратов и их способности преодолевать ГЭБ. Использованы литературные данные по ВВВ+/- для 1513 соединений. Для указанного ряда веществ 1276 были отнесены к ВВВ+ и 237 к ВВВ. Компьютерное моделирование взаимосвязи структура-активность осуществлялось по двум направлениям: метод структурной аналогии ("read-across") и линейный дискриминантный анализ (ЛДА) на основе физико-химических дескрипторов. Главным параметром, определяющим проницаемость через ГЭБ, оказалась сумма водород-связывающих донорно-акцепторных факторов.
Раевский О.А., Солодова С.Л., Раевская О.Е., Липлавский Я.В., Манхольд Р. (2012) Компьютерные классификационные модели взаимосвязи структуры химических соединений и лекарств с их способностью проникать через гематоэнцефалический барьер. Биомедицинская химия, 58(3), 246-256.
Раевский О.А. и др. Компьютерные классификационные модели взаимосвязи структуры химических соединений и лекарств с их способностью проникать через гематоэнцефалический барьер // Биомедицинская химия. - 2012. - Т. 58. -N 3. - С. 246-256.
Раевский О.А. и др., "Компьютерные классификационные модели взаимосвязи структуры химических соединений и лекарств с их способностью проникать через гематоэнцефалический барьер." Биомедицинская химия 58.3 (2012): 246-256.
Раевский, О. А., Солодова, С. Л., Раевская, О. Е., Липлавский, Я. В., Манхольд, Р. (2012). Компьютерные классификационные модели взаимосвязи структуры химических соединений и лекарств с их способностью проникать через гематоэнцефалический барьер. Биомедицинская химия, 58(3), 246-256.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750812010131
Список литературы
Бредбери М. (1983) Концепция гематоэнцефалического барьера (пер. с англ.), Медицина, М. Scholar google search
Покровский В.М., Коротько Г.Ф., Кобрин В.И. и др. (1997) Физиология человека: Учебник, Медицина, М. Scholar google search
Lipinski C.A., Lombardo F., Dominy B.W., Feeney P.J. (1997) Adv. Drug Delivery Rev., 23, 3-25. Scholar google search
van de Waterbeemd H., Camenisch G., Folkers G., Chretien J.R., Raevsky O.A. (1998) J. Drug Targeting, 6, 151-165. CrossRef Scholar google search
Adenot M., Lahana R.J. (2004) Chem. Inf. Comput. Sci., 44, 239-248. Scholar google search
Zhao Y.H., Abraham M.H., Ibrahim A., Fish P.V., Cole S., Lewis M.L., de Groot M.J., Reynolds D.P. (2007) J. Chem. Inf. Model., 47, 170-175. Scholar google search
Raevsky O.A. (2004) Minireview in Medicinal Chemistry, 4, 1041-1052. Scholar google search
Raevsky O.A. (2008) In: Molecular Drug Properties. Measurement and Prediction (Mannhold R., ed.). Wiley-VCH Verlag GmbH & Co.KGaA, Weinheim, pp. 127-154. Scholar google search
Ertl P. (2008) Polar surface area In: Molecular Drug Properties. Measurement and Prediction (Mannhold R., ed.) Wiley-VCH Verlag GmbH & Co.KGaA, Weinheim, pp. 127-154. Scholar google search
Raevsky O.A., Skvortsov V.S. (2005) SAR & QSAR in Environmental Research, 15, 287-300. Scholar google search
Hansch C., Leo A., Hoekman D. (1995) Exploring QSAR: Hydrophobic, Electronic, and Steric Constants. American Chemical Society, Washington, DC. Scholar google search
Раевский О.А., Григорьев В.Ю., Трепалин С.В. (26.02.1999) Программа HYBOT, Роспатент № 990090. Scholar google search
SYBYL: SYBYL 8.0, Tripos International, 1699 South Hanley Rd., St. Louis, Missouri, 63144, USA. Scholar google search
Раевский О.А., Скворцов В.С. (27.09.2004) Программа 3D HYBOT, Роспатент № 2004612207. Scholar google search
Organization for Economic Cooperation and Development. Guidance on Grouping of Chemicals, OECD, Paris (2007). Scholar google search
European Chemical Agency, Guidance on Information Requirements and Chemical Safety Assessment, Chapter R6, QSAR and grouping of chemicals, ECHA, Helsinki (2008). Scholar google search
Dimitrov S., Mekenyan O. (2010) An Introduction to Read-Across for the Prediction of the Effects of Chemicals, in "In Silico Toxicology. Principles and Applications". (Cronin M.T.D., Madden J.C., eds.), RSC, Cambridge, pp. 372-384. Scholar google search
Diderich R. (2010) Tools for Category Formation and Read-Across: Overview of the OECD (Q)SAR Application Toolbox, ibid., pp. 385-407. Scholar google search
Jeliazkova N., Jaworska J., Worth A.P. (2010) Open Source Tools for Read-Across and Category Formation, ibid, pp. 408-445. Scholar google search
Raevsky O.A., Grigor`ev V.Yu., Modina E.A., Worth A. (2010) SAR and QSAR in Environmental Research, 21, 265-275. Scholar google search
Раевский О.А., Герасименко В.А., Трепалин С.В. (26.02.1999) Программа MOLDIVS, Роспатент № 990093. Scholar google search
Gerasimenko V.A., Trepalin S.V., Raevsky O.A. (2000) MOLDIVS - A New Program for Molecular Similarity and Diversity Calculations, in "Molecular Modelling and Prediction of Bioactivity", (Gundertofe K., Jorgensen F., eds.), Kluwer Academic/Plenum Publ., pp. 423-424. Scholar google search
PharmaAlgorithms. ADME Boxes, Version 3.0; PharmaAlgorithms, Inc.: 591 Indian Road, Toronto, ON M6P 2C4, Canada. Scholar google search
Lipinski C.A. Drugs structure and properties, past and present. Can we design drugs with beautiful properties? http://www.iainm.demon.co.uk/spring99/lipins_n.pdf . Scholar google search
