Расчет острой токсичности химических соединений при их внутривенном введении мышам на основе локальных регрессионных моделей в перекрывающихся кластерах (ЛРМПК)
Приведено компьютерное моделирование взаимосвязи физико-химических дескрипторов органических соединений и их острой токсичности при внутривенном введении мышам. Данный подход включает три стадии: отбор структурно-родственных соединений для каждого из рассматриваемых соединений указанной выборки (кластеризация), построение количественных соотношений структура-токсичность для каждого кластера (без включения рассматриваемого соединения), применение построенных КССА уравнений для оценки токсичности рассматриваемых соединений. Этот подход был использован для расчёта токсичности 10241 соединений при их внутривенном введении. Для 7759 соединений из указанного общего числа, имеющих структурных соседей с индексом сходства (индекс Танимото) на уровне 0,30 и выше, стандартное отклонение рассчитанных значений от экспериментальных составило 0,51 при ошибке экспериментального определения ±0,50 в величине log(1/LD50). Для оставшихся соединений (~24%) результаты расчетов не столь совершенны, что связано с отсутствием для них достаточного числа структурно-родственных аналогов. Предполагается, что описанная в данной статье КССА модель может быть полезной для предсказания биологической активности и токсичности больших массивов соединений.
Раевский О.А., Липлавская Е.А., Вортс А.П., Григорьев В.Ю. (2012) Расчет острой токсичности химических соединений при их внутривенном введении мышам на основе локальных регрессионных моделей в перекрывающихся кластерах (ЛРМПК). Биомедицинская химия, 58(5), 489-500.
Раевский О.А. и др. Расчет острой токсичности химических соединений при их внутривенном введении мышам на основе локальных регрессионных моделей в перекрывающихся кластерах (ЛРМПК) // Биомедицинская химия. - 2012. - Т. 58. -N 5. - С. 489-500.
Раевский О.А. и др., "Расчет острой токсичности химических соединений при их внутривенном введении мышам на основе локальных регрессионных моделей в перекрывающихся кластерах (ЛРМПК)." Биомедицинская химия 58.5 (2012): 489-500.
Раевский, О. А., Липлавская, Е. А., Вортс, А. П., Григорьев, В. Ю. (2012). Расчет острой токсичности химических соединений при их внутривенном введении мышам на основе локальных регрессионных моделей в перекрывающихся кластерах (ЛРМПК). Биомедицинская химия, 58(5), 489-500.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750811040081
Raevsky O.A., Dearden J.C. (2004) SAR QSAR in Environ. Res., 15(5/6), 433-448. Scholar google search
Wold S., Sjostrom M. (1977) in: Chemometrics: Theory and Application (Kowalski B.R., ed.) ACS Symp. Series №52, ACS, Washington, pp. 243-282. Scholar google search
SYMYX Toxicity Database. Available at htttp://www.symyx.com/products/databases/index.jsp. Scholar google search
Raevsky O.A. (1997) in: Computer-Assisted Lead Finding and Optimization (Waterbeemd H., Testa B., Folkers G., eds.), Verlag, Basel, pp. 367-378. Scholar google search
DRAGON, Talete srl, Italy. Available at http://www.talete.mi.it/dragon.htm. Scholar google search
Gerasimenko V.A., Trepalin S.V., Raevsky O.A. (2000) in: Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity (Gundertofte K., Jorgensen F.S., eds.), Kluwer Academic/Plenum Publishers, New York, pp. 423-424. CrossRef Scholar google search
