Staphylococcus aureus - один из наиболее интересных для клинических исследований видов микроорганизмов, обладающий большим штаммовым разнообразием, в первую очередь за счёт вариабельности факторов вирулентности и патогенности. Целью настоящего исследования явилась апробация метода быстрой штаммовой дифференциации стафилококков по определённому признаку на основании регистрации отличительных особенностей MALDI масс-спектров, накапливаемых в ходе прямого белкового профилирования бактериальной клетки. В качестве модельных признаков, регистрируемых как штаммовые отличия, были выбраны продукция β-лактамазы и α-гемолизина, обусловленные наличием генов blaZ и hla соответственно. Математический анализ совокупности MALDI масс-спектров, накопленных для 53 изолятов S. aureus c применением генетического алгоритма кластеризации, позволил построить две независимые классификационные модели, способные дифференцировать штаммы по рассматриваемым признакам. По статистическому вкладу в модель каждого масс-пика были выявлены наиболее значимые пики (массы), которые можно рассматривать как маркеры штаммовых различий стафилококков. Построенные диагностические модели отличались коэффициентами чувствительности и специфичности, которые составили 97,5% и 82,5% для разделения штаммов по признаку продукции β-лактамазы и 90,0% и 88,7% по наличию α-гемолизина.
Корниенко М.А. и др. Штаммовая классификация staphylococcus aureus посредством прямого масс-спектрометрического профилирования // Биомедицинская химия. - 2012. - Т. 58. -N 5. - С. 501-513.
Корниенко М.А. и др., "Штаммовая классификация staphylococcus aureus посредством прямого масс-спектрометрического профилирования." Биомедицинская химия 58.5 (2012): 501-513.
Корниенко, М. А., Ильина, Е. Н., Боровская, А. Д., Эдельштейн, М. В., Сухорукова, М. В., Кострцева, М., Говорун, В. М. (2012). Штаммовая классификация staphylococcus aureus посредством прямого масс-спектрометрического профилирования. Биомедицинская химия, 58(5), 501-513.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750813010095
Список литературы
Plata K., Rosato A.E., Wegrzyn G. (2009) Acta Biochim. Pol., 56(4), 597-612. Scholar google search
Сидоренко C.B. (2003) Инфекции и антимикробная терапия, 5(2), 48-55. Scholar google search
Hartman B.J., Tomasz A. (1984) J. Bacteriol., 158(2), 513-516. Scholar google search
Turlej A., Hryniewicz W., Empel J. (2011) Pol. J. Microbiol., 60(2), 95-103. Scholar google search
Cui L., Iwamoto A., Lian J.Q., Neoh H.M., Maruyama T., Horikawa Y., Hiramatsu K. (2006) Antimicrob. Agents Chemother., 50(2), 428-438. CrossRef Scholar google search
Rong S.L., Leonard S.N. (2010) Ann .Pharmacother., 44(5), 844-850. Scholar google search
Mellmann A., Cloud J., Maier T., Keckevoet U., Ramminger I., Iwen P., Dunn J., Hall G., Wilson D., Lasala P., Kostrzewa M., Harmsen D. (2008) J. Clin. Microbiol., 46(6), 1946-1954. CrossRef Scholar google search
Dubois D., Leyssene D., Chacornac J.P., Kostrzewa M., Schmit P.O., Talon R., Bonnet R., Delmas J. (2009) J. Clin. Microbiol., 48(3), 941-945. CrossRef Scholar google search
Ilina E.N., Borovskaya A.D., Serebryakova M.V., Chelysheva V.V., Momynaliev K.T., Maier T., Kostrzewa M., Govorun V.M. (2010) Rapid Commun Mass Spectrom., 24(3), 328-334. CrossRef Scholar google search
Szabados F., Woloszyn J., Richter C., Kaase M., Gatermann S. (2010) J. Med. Microbiol., 59(Pt 7), 787-790. CrossRef Scholar google search
Bessede E., Angla-Gre M., Delagarde Y., Sep Hieng S., Menard A., Megraud F. (2011) Clin. Microbiol. Infect, 17(4), 533-538. CrossRef Scholar google search
Yan Y., He Y., Maier T., Quinn C., Shi G., Li H., Stratton C.W., Kostrzewa M., Tang Y.W. (2011) J. Clin. Microbiol., 49(7), 2528-2532. CrossRef Scholar google search
