Штаммовая классификация staphylococcus aureus посредством прямого масс-спектрометрического профилирования

   
Корниенко М.А.1 , Ильина Е.Н.1, Боровская А.Д.1, Эдельштейн М.В.2, Сухорукова М.В.2, Кострцева М.3, Говорун В.М.1

1. ФГУ НИИ Физико-химической медицины ФМБА России
2. НИИ Антимикробной химиотерапии СГМА России
3. Bruker Daltonik GmbH
Раздел: Экспериментальные/клинические исследование
DOI: 10.18097/pbmc20125805501      Идентификатор PubMed: 23289292
Год: 2012  том: 58  выпуск: 5  страницы: 501-513
Staphylococcus aureus - один из наиболее интересных для клинических исследований видов микроорганизмов, обладающий большим штаммовым разнообразием, в первую очередь за счёт вариабельности факторов вирулентности и патогенности. Целью настоящего исследования явилась апробация метода быстрой штаммовой дифференциации стафилококков по определённому признаку на основании регистрации отличительных особенностей MALDI масс-спектров, накапливаемых в ходе прямого белкового профилирования бактериальной клетки. В качестве модельных признаков, регистрируемых как штаммовые отличия, были выбраны продукция β-лактамазы и α-гемолизина, обусловленные наличием генов blaZ и hla соответственно. Математический анализ совокупности MALDI масс-спектров, накопленных для 53 изолятов S. aureus c применением генетического алгоритма кластеризации, позволил построить две независимые классификационные модели, способные дифференцировать штаммы по рассматриваемым признакам. По статистическому вкладу в модель каждого масс-пика были выявлены наиболее значимые пики (массы), которые можно рассматривать как маркеры штаммовых различий стафилококков. Построенные диагностические модели отличались коэффициентами чувствительности и специфичности, которые составили 97,5% и 82,5% для разделения штаммов по признаку продукции β-лактамазы и 90,0% и 88,7% по наличию α-гемолизина.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: Staphylococcus, штаммовая дифференциация, MALDI-MS
Цитирование:

Корниенко, М. А., Ильина, Е. Н., Боровская, А. Д., Эдельштейн, М. В., Сухорукова, М. В., Кострцева, М., Говорун, В. М. (2012). Штаммовая классификация staphylococcus aureus посредством прямого масс-спектрометрического профилирования. Биомедицинская химия, 58(5), 501-513.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750813010095
Список литературы  
 2022 (том 68)
 2021 (том 67)
 2020 (том 66)
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)