1. Учреждение Российской академии наук Государственный научный центр РФ - Институт медико-биологических проблем РАН 2. Федеральное государственное бюджетное учреждение Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича Российской академии медицинских наук
Целью данного обзора является анализ работ, посвященных характеристике степени вариабельности белков и разнообразию их посттрансляционных модификаций у здорового человека. Многочисленными исследованиями продемонстрировано, что протеомный профиль выявляет значительную групповую и индивидуальную вариабельность, причем нередко естественная ("нормальная") вариабельность уровня некоторых белков может быть соотносимой или даже большей, чем уровни, присущие патологии. Результаты, полученные нашей группой, показали высокую вариабельность низкомолекулярного субпротеома сыворотки крови (коэффициент вариации (CV) 42,6%) у здоровых лиц, отобранных специальной медицинской комиссией. Белки, характеризующиеся высоким разбросом концентраций в норме (например, гаптоглобин - 0-40 мг/мл; лизоцим - 0,01-0,1 мг/мл; С-реактивный белок - 0,01-0,3 мг/мл), не следует рассматривать как возможные биомаркеры заболеваний. Напротив, резкое изменение уровня белков и пептидов, обладающих незначительной дисперсией в популяции здоровых лиц и стабильных во времени (такие как альбумин - CV 9%; трансферрин - CV 14%; комплемент С3с - CV 17%, кислый α-1-гликопротеин - CV 21%, α2-макроглобулин - CV 20%; фрагменты транстиретина - CV 28,3% и β-цепи α2-HS-гликопротеина - CV 29,7%), может дать важную информацию о состоянии здоровья. Таким образом, знание пределов пластичности протеомного профиля здорового человека поможет скорректировать существующие границы физиологической нормы, принятые в клинической протеомике.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: вариабельность, протеомный профиль, здоровый человек
Пахарукова Н.А. и др. Вариабельность протеома здорового человека // Биомедицинская химия. - 2012. - Т. 58. -N 5. - С. 514-529.
Пахарукова Н.А. и др., "Вариабельность протеома здорового человека." Биомедицинская химия 58.5 (2012): 514-529.
Пахарукова, Н. А., Пастушкова, Л. Х., Мошковский, С. А., Ларина, И. М. (2012). Вариабельность протеома здорового человека. Биомедицинская химия, 58(5), 514-529.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750811030097
Vlahou A., Gregory B., Wright J., Gregory B., Fournier K., McGaughey D., Perry R.R., Wright G.L. Jr., Semmes O.J. (2003) Clin. breast cancer, 4, 203-209. CrossRef Scholar google search
Koopmann J., Zhang Z., White N., Rosenzweig J., Fedarko N., Jagannath S., Canto M.I., Yeo C.J., Chan D.W., Goggins M. (2004) Clin. Cancer Res., 10, 860-868. CrossRef Scholar google search
Engwegen J.Y., Helgason H.H., Cats A., Harris N., Bonfrer J.M., Schellens J.H., Beijnen J.H. (2006) World J. Gastroenterol., 12, 1536-1544. Scholar google search
Engwegen J.Y., Depla A.C., Smith M.E., Cats A., Tuynman H., van Heukelem H.A., Snel P., Meuleman W., Wessels L.F., Schellens J.H., Beijnen J.H. (2008) Biomarker Insights, 2, 375-385. Scholar google search
Miguet L., Bogumil R., Decloquement P., Herbrecht R., Potier N., Mauvieux L., Van Dorsselaer A. (2006) J. Proteome Res., 5, 2258-2269. CrossRef Scholar google search
Zheng P.P., Luider T.M., Pieters R., Avezaat C.J., van den Bent M.J., Sillevis Smitt P.A., Kros J.M. (2003) J. Neuropathol. Exp. Neurol., 62, 855-862. Scholar google search
Carrette O., Demalte I., Scherl A., Yalkinoglu O., Corthals G., Burkhard P., Hochstrasser D.F., Sanchez J.C. (2003) Proteomics, 3, 1486 -1494. CrossRef Scholar google search
Guillaume E., Zimmerman C., Burkhard P.R., Hochstrasser D.F., Sanchez J.C. (2003) Proteomics, 3, 1495-1499. CrossRef Scholar google search
Baggerly K.A., Morris J.S., Edmonson S.R., Coombes K.R. (2005) J. Natl. Cancer Inst., 97, 307-309. CrossRef Scholar google search
Rai A.J., Stemmer P.M., Zhang Z., Adam B.L., Morgan W.T., Caffrey R.E., Podust V.N., Patel M., Lim L.Y., Shipulina N.V., Chan D.W., Semmes O.J., Leung H.C. (2005) Proteomics, 5, 3467-3474. CrossRef Scholar google search
Semmes O.J., Feng Z., Adam B.L., Banez L.L., Bigbee W.L., Campos D., Cazares L.H., Chan D.W., Grizzle W.E., Izbicka E., Kagan J., Malik G., McLerran D., Moul J.W., Partin A., Prasanna P., Rosenzweig J., Sokoll L.J., Srivastava S., Thompson I., Welsh M.J., White N., Winget M., Yasui Y., Zhang Z., Zhu L. (2005) Clin. Chem., 51, 102-112. CrossRef Scholar google search
Whiteaker J.R., Zhang H., Eng J.K., Fang R., Piening B.D., Feng L.C.,Lorentzen T.D., Schoenherr R.M., Keane J.F., Holzman T., Fitzgibbon M., Lin C., Zhang H., Cooke K., Liu T., Camp D.G. 2nd, Anderson L., Watts J., Smith R.D., McIntosh M.W., Paulovich A.G. (2007) J. Proteome Res., 6, 828-836 . CrossRef Scholar google search
Baumann S., Ceglarek U., Fiedler J.M., Lembcke J., Leichtle A., Thiery J. (2005) Clin. Chem., 51, 973-980. CrossRef Scholar google search
Tiss A., Smith C., Camuzeaux S., Kabir M., Gayther S., Menon U., Waterfield M., Timms J., Jacobs I., Cramer R. (2007) Practical proteomics, 7 Suppl 1, 77-89. Scholar google search
Jorge I., Navarro R.M., Lenz C., Ariza D., Porras C., Jorrin J. (2005) Proteomics, 5, 222-234. CrossRef Scholar google search
Ramirez-Boo M., Garrido J.J., Ogueta S., Calvete J.J., Gomez-Diaz C., Moreno A. (2006) Proteomics, 6, S215-S225. CrossRef Scholar google search
Molloy M.P., Brzezinski E.E., Hang J., McDowell M.T., VanBogelen R.A. (2003) Proteomics, 3, 1912-1919. CrossRef Scholar google search
Zhang X., Guo Y., Song Y., Sun W., Yu C., Zhao X., Wang H., Jiang H., Li Y., Qian X., Jiang Y., He F. (2006) Proteomics, 6, 5260-5268. CrossRef Scholar google search
Sanchez J.C., Schaller D., Ravier F., Golaz O., Jaccoud S., Belet M., Wilkins M.R., James R., Deshusses J., Hochstrasser D. (1997) Electrophoresis, 18, 150-155. CrossRef Scholar google search
Winkler W., Zellner M., Diestinger M., Babeluk R., Marchetti M., Goll A., Zehetmayer S., Bauer P., Rappold E., Miller I., Roth E., Allmaier G., Oehler R. (2008). Mol. Cell. Proteomics, 7, 193-203. CrossRef Scholar google search
Corzett T.H., Fodor I.K., Choi M.W., Walsworth V.L., Turteltaub K.W., McCutchen-Maloney S.L., Chromy B.A. (2010) J. Biomed. Biotechnol., doi: 10.1155/2010/258494, Epub 2010 Jan 14. CrossRef Scholar google search
Пахарукова Н.А., Пастушкова Л.Х., Трифонова О.П., Мошковский С.А., Ларина И.М. (2011) Физиология человека, 37(2), 1-9. Scholar google search
Устав Всемирной Организации Здравоохранения http://apps.who.int/gb/bd/PDF/bd47/RU/constitution-ru.pdf . Scholar google search
Уильямс Р. (1960) Биохимическая индивидуальность: Основы генетотрофной концепции. (пер. с англ.), М.: Иностранная литература. - 296 с. Scholar google search
Корольков А.А. (1979) Диалектика и теоретическая медицина. М.: Медицина, 1979. - 235 с. Scholar google search
Григорьев А.И., Баевский Р.М. (2001) Концепция здоровья и проблема нормы в космической медицине. М.: Слово, 96 с. Scholar google search
Hyltoft Petersen P., Felding P., Hørder M., Tryding N. (1980) Scand. J. Clin. Lab. Invest., 40, 623-628. CrossRef Scholar google search
Linkowski P., Spiegel K., Kerkhofs M., L`Hermite-Baleriaux M., Van Onderbergen A., Leproult R., Mendlewicz J., Van Cauter E. (1998) Am. J. Physiol., 274, 909-919. Scholar google search
Балаболкин М.И. (1998) Эндокринология. М.: Универсум паблишинг, 416 c. Scholar google search
Левин Я.И. (2007) Русский медицинский журнал. Неврология и психиатрия, 15, 1851-1855. Scholar google search
Ларина И.М., Моруков Б.В., Григорьев А.И. (1999) Физиология человека, 25(6), 89-95. Scholar google search
Bruguerolle B., Bouvenot G., Arnaud C., Levy F., Mechkouri M., Bartolin R., Peronne R. (1986) Rev. Rhum. Mal. Osteoartic., 53, 313-316. Scholar google search
Wiedermann D., Kriz J., Cidl K. (1980) Czech. Med., 3, 239-247. Scholar google search
Aldred S., Sozzi T., Mudway I., Grant M.M., Neubert H., Kelly F.J., Griffiths H.R. (2006) Proteomics, 6, 1695-1703. CrossRef Scholar google search
de Roos B., Geelen A., Ross K., Rucklidge G., Reid M., Duncan G., Caslake M., Horgan G., Brouwer I.A. (2008) Proteomics, 8, 1965-1974. CrossRef Scholar google search
Vermeulen R., Lan Q., Zhang L., Gunn L., McCarthy D., Woodbury R.L., McGuire M., Podust V.N., Li G., Chatterjee N., Mu R., Yin S., Rothman N., Smith M.T. (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, 1704-1716. CrossRef Scholar google search
Kap-Soon N., Do-Youn L., Hak C.J., Joo W.A., Lee E, Chan-Wha K. (2004) Proteomics, 4, 3505-3513. CrossRef Scholar google search
Trifonova O., Larina I., Grigoriev A., Lisitsa A., Moshkovskii S., Archakov A. (2010) Expert Rev. Proteomics. 7, 431-438. CrossRef Scholar google search
