1. Федеральное государственное бюджетное учреждение “Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича” Российской академии медицинских наук
Наиболее частым побочным эффектом нестероидных противовоспалительных средств (НПВС) является развитие пептических язв. Экспериментальные данные указывают на то, что объяснить патогенез пептических язв на основе ингибирования одних только циклооксигеназ не представляется возможным. Информация о других молекулярных механизмах действия лекарств, играющих роль в патогенезе пептических язв, может быть использована для конструирования новых, более безопасных НПВС. Однако соответствующие экспериментальные исследования требуют значительных временных и материальных затрат. Для ограничения области экспериментального поиска нами разработан подход к идентификации in silico предполагаемых молекулярных механизмов действия лекарств, связанных с побочными эффектами. Нами была создана выборка НПВС из 85 структур соединений с данными о побочных эффектах. Для оценки неизвестных молекулярных механизмов действия соединений выборки использовали компьютерную программу PASS (Prediction of Activity Spectra for Substances), которая позволяет прогнозировать более 3000 молекулярных механизмов действия лекарств по структурной формуле веществ. Между спрогнозированными молекулярными механизмами действия и развитием пептических язв найдены статистически значимые ассоциации. Всего выявлено 26 молекулярных механизмов действия (два известных ранее и двадцать четыре новых), предположительно связанных с развитием пептических язв. На основе анализа данных Gene Ontology, сигнальных и метаболических путей, и публикаций в Medline, удалось сформулировать гипотезы о вкладе 10 молекулярных механизмов действия в патогенез пептических язв.
Иванов С.М. и др. Компьютерный поиск молекулярных механизмов ульцерогенного действия нестероидных противовоспалительных средств // Биомедицинская химия. - 2014. - Т. 60. -N 1. - С. 7-16.
Иванов С.М. и др., "Компьютерный поиск молекулярных механизмов ульцерогенного действия нестероидных противовоспалительных средств." Биомедицинская химия 60.1 (2014): 7-16.
Иванов, С. М., Лагунин, А. А., Захаров, А. В., Филимонов, Д. А., Поройков, В. В. (2014). Компьютерный поиск молекулярных механизмов ульцерогенного действия нестероидных противовоспалительных средств. Биомедицинская химия, 60(1), 7-16.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S199075081301006X
Список литературы
Al Mofleh I.A., Al Rashed R.S. (2007) Saudi J. Gastroenterol., 13(3), 107-113. Scholar google search
Musumba C., Pritchard D.M., Pirmohamed M. (2009) Aliment. Pharmacol. Ther., 30(6), 517-531. Scholar google search
Suleyman H., Albayrak A., Bilici M., Cadirci E., Halici Z. (2010) Inflammation, 33(4), 224-234. Scholar google search
Pallis M., Bradshaw T.D., Westwell A.D., Grundy M., Stevens M.F., Russell N. (2003) Biochem. Pharmacol., 66(9), 1695-1705. CrossRef Scholar google search
Maruyama K., Okazaki I., Arai M., Kurose I., Komatsu H., Nakamura M., Tsuchiya M. (1995) J. Gastroenterol., 30(3), 301-309. CrossRef Scholar google search
Kim N., Yoo J.C., Han J.Y., Hwang E.M., Kim Y.S., Jeong E.Y., Sun C.H., Yi G.S., Roh G.S., Kim H.J., Kang S.S., Cho G.J., Park J.Y., Choi W.S. (2012) J. Cell. Physiol., 227(3), 1157-1167. CrossRef Scholar google search
