Метаболомика – самая молодая “омная” наука, занимающаяся анализом всей
совокупности низкомолекулярных веществ (метаболитов) биологических объектов.
Метаболические профили являются молекулярным фенотипом живых систем, и отражают
информацию, заложенную на геномном и реализованную на транскриптомном и протеомном
уровнях. Анализ метаболомного профиля крови позволяют учесть влияние как внутренних
(эндогенных), так и внешних (экзогенных) факторов, воздействующих на организм,
что делает его универсальными и перспективными в плане клинического применения.
В данном обзоре обсуждена техническая реализация метаболомного профилирования
крови, методы статистического анализа метаболических профилей для расчета рисков
и диагностики заболеваний.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: метаболомика, метаболомный профиль, масс-спектрометрия, плазма/сыворотка крови
Ellis D.I., Dunn W.B., Griffin J.L., Allwood J.W., Goodacre R. (2007) Pharmacogenomics, 8, 1243-1266. CrossRef Scholar google search
Schauer N., Steinhauser D., Strelkov S., Schomburg D., Allison G., Moritz T., Lundgren K., Roessner-Tunali U., Forbes M.G., Willmitzer L., Fernie A.R., Kopka J. (2005) FEBS Lett., 579, 1332-1337. CrossRef Scholar google search
Begley P., Francis-McIntyre S., Dunn W.B., Broadhurst D.I., Halsall A., Tseng A., Knowles J., Goodacre R., Kell D.B. (2009) Anal. Chem., 81, 7038-7046. CrossRef Scholar google search
Wilson I.D., Nicholson J.K., Castro-Perez J., Granger J.H., Johnson K.A., Smith B.W., Plumb R.S. (2005) J. Proteome Res., 4, 591-598. CrossRef Scholar google search
Jonsson P., Bruce S.J., Moritz T., Trygg J., Sjostrom M., Plumb R., Granger J., Maibaum E., Nicholson J.K.,Holmes E.,Antti H. (2005)Analyst, 130, 701-707. CrossRef Scholar google search
Broeckling C.D., Reddy I.R., Duran A.L., Zhao X., Sumner L.W. (2006) Anal. Chem., 78, 4334-4341. CrossRef Scholar google search
Baran R., Kochi H., Saito N., Suematsu M., Soga T., Nishioka T., Robert M., Tomita M. (2006) BMC Bioinformatics, 7, 530. CrossRef Scholar google search
Denkert C., Budczies J., Weichert W., Wohlgemuth G., Scholz M., Kind T., Niesporek S., Noske A., Buckendahl A., Dietel M., Fiehn O. (2008) Mol. Cancer., 7, 72. Scholar google search
Wishart D.S., Tzur D., Knox C., Eisner R., Guo A.C., Young N., Cheng D., Jewell K., Arndt D., Sawhney S., Fung C., Nikolai L., Lewis M., Coutouly M.A., Forsythe I., Tang P., Shrivastava S., Jeroncic K., Stothard P., Amegbey G., Block D., Hau D.D., Wagner J., Miniaci J., Clements M., Gebremedhin M., Guo N., Zhang Y., Duggan G.E., Macinnis G.D., Weljie A.M., Dowlatabadi R., Bamforth F., Clive D., Greiner R., Li L., Marrie T., Sykes B.D., Vogel H.J., Querengesser L. (2007) Nucleic Acids Res., 35 (Database issue), D521-526. CrossRef Scholar google search
Wishart D.S., Knox C., Guo A.C., Eisner R., Young N., Gautam B., Hau D.D., Psychogios N., Dong E., Bouatra S., Mandal R., Sinelnikov I., Xia J., Jia L., Cruz J.A., Lim E., Sobsey C.A., Shrivastava S., Huang P., Liu P., Fang L., Peng J., Fradette R., Cheng D., Tzur D., Clements M., Lewis A., De Souza A., Zuniga A., Dawe M., Xiong Y., Clive D., Greiner R., Nazyrova A., Shaykhutdinov R., Li L., Vogel H.J., Forsythe I. (2009) Nucleic Acids Res., 37 (Database issue), D603-610. CrossRef Scholar google search
Sabatine M.S., Liu E., Morrow D.A., Heller E., McCarroll R., Wiegand R., Berriz G.F., Roth F.P., Gerszten R.E. (2005) Circulation, 112, 3868-3875. CrossRef Scholar google search
Wang T.J., Larson M.G., Vasan R.S., Cheng S., Rhee E.P., McCabe E., Lewis G.D., Fox C.S., Jacques P.F., Fernandez C., O'Donnell C.J., Carr S.A., Mootha V.K., Florez J.C., Souza A., Melander O., Clish C.B., Gerszten R.E. (2011) Nat. Med., 17, 448-453. Scholar google search
Odunsi K., Wollman R.M., Ambrosone C.B., Hutson A., McCann S.E., Tammela J., Geisler J.P., Miller G., Sellers T., Cliby W., Qian F., Keitz B., Intengan M., Lele S., Alderfer J.L. (2005) Int. J. Cancer, 113, 782-788. CrossRef Scholar google search
Sun J., Shannon M., Ando Y., Schnackenberg L.K., Khan N.A., Portilla D., Beger R.D. (2012) J. Chromatogr. B Analyt. Technol. Biomed. Life Sci., 893-894, 107-113. CrossRef Scholar google search
Gutiu I.A., Andries A., Radulescu F., Georgescu A-M., Cioaca D. (2010) Rom. J. Intern. Med., 48, 187-191. Scholar google search
Kaddurah-Daouk R., Kristal B.S., Weinshilboum R.M. (2008) Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol., 48, 653-683. CrossRef Scholar google search
