1. Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”, ФГБУ Петербургский институт ядерной физики им. Б.П.Константинова (ФГБУ ПИЯФ), 2ФГБУ “Научно-исследовательский институт биомедицинской химии
им. В.Н. Ореховича” РАМН 2. Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”, ФГБУ Петербургский институт ядерной физики им. Б.П.Константинова (ФГБУ ПИЯФ) 3. ФГБУ “Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича” РАМН
Глиобластома является наиболее частой опухолью мозга. По смертности она занимает 4 место среди раковых заболеваний. В наших экспериментах мы использовали несколько глиобластомных клеточных линий для получения протеомной информации, характерной для данного заболевания. Разделение белков двумерным электрофорезом с последующим окрашиванием, анализом изображений и белковых пятен, масс-спектрометрической и иммунологической идентификацией белков, позволило нам визуализировать более 600 белковых пятен и идентифицировать более 130 из них. Протеомные профили в нормальных и глиобластомных клетках очень похожи, однако уровни содержания многих белков сильно отличаются. Среди таких белков – альфа-енолаза (ENOA_HUMAN), изофермент пируваткиназы M1/M2 (KPYM_HUMAN), кофилин 1 (COF1_HUMAN), опухолевый белок TCTP (TCTP_HUMAN), аннексин 1 (ANXA1_HUMAN), аннексин 2 (ANXA2_HUMAN), PCNA (PCNA_HUMAN), p53 (TP53_HUMAN) и другие. Самые интересные результаты были получены для белка р53. По сравнению с нормальными клетками в глиобластомных клетках уровень данного белка не только сильно повышен, но и ещё и сопровождается появлением множества дополнительных форм. Использование иммуноферментного анализа (Вестерн-блота) трех хаб-белков (р53, 14-3-3 и PCNA) позволило получить минимальный штрих-код глиобластомных линий. Использование такого штрих-кода даст возможность проведения диагностики с использованием биологических жидкостей пациентов.
Нарыжный С.Н. и др. Разработка штрих-кода и получение белкового профиля глиобластомы // Биомедицинская химия. - 2014. - Т. 60. -N 3. - С. 308-321.
Нарыжный С.Н. и др., "Разработка штрих-кода и получение белкового профиля глиобластомы." Биомедицинская химия 60.3 (2014): 308-321.
Нарыжный, С. Н., Ронжина, Н. Л., Майнскова, М. А., Белякова, Н. В., Пантина, Р. А., Филатов, М. В. (2014). Разработка штрих-кода и получение белкового профиля глиобластомы. Биомедицинская химия, 60(3), 308-321.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750814030111
Список литературы
Furnari F.B., Fenton T., Bachoo R.M., Mukasa A., Stommel J.M., Stegh A., Hahn W.C., Ligon K.L., Louis D.N., Brennan C., Chin L., DePinho R.A., Cavenee W.K. (2007) Genes Dev., 21, 2683-710. CrossRef Scholar google search
Louis D.N., Ohgaki H., Wiestler O.D., Cavenee W.K., Burger P.C., Jouvet A., Scheithauer B.W., Kleihues P. (2007) Acta Neuropathol., 114, 97-109. CrossRef Scholar google search
Hegi M.E., Diserens A.C., Gorlia T., Hamou M.F., de Tribolet N., Weller M., Kros J.M., Hainfellner J.A., Mason W., Mariani L., Bromberg J.E., Hau P., Mirimanoff R.O., Cairncross J.G., Janzer R.C., Stupp R. (2005) N. Engl. J. Med., 352, 997-1003. CrossRef Scholar google search
D'Alessandro A., Righetti P.G., Zolla L. (2010) J. Proteome Res., 9, 144-63. Scholar google search
Vogel T.W., Zhuang Z., Li J., Okamoto H., Furuta M., Lee Y.S., Zeng W., Oldfield E.H., Vortmeyer A.O., Weil R.J. (2005) Clin. Cancer Res.,11, 3624-3632. CrossRef Scholar google search
Billecke C., Malik I., Movsisyan A., Sulghani S., Sharif A., Mikkelsen T., Farrell N.P., Bogler O. (2006) Mol. Cell Proteomics, 5, 35–42. CrossRef Scholar google search
