В настоящее время отсутствуют надежные биомаркеры сыворотки/плазмы крови для раннего обнаружения рака желудка (РЖ) – одной из наиболее распространённых злокачественных опухолей. В данном исследовании разработана, унифицирована и апробирована новая методология поиска биомаркеров РЖ – профилирование низкомолекулярного протеома (НМП) плазмы крови (1-17 кДа). Данный подход включал три основных компонента: предварительную подготовку образцов, времяпролетную масс-спектрометрию с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF-MS), обработку данных с помощью биоинформационного пакета программ. Продемонстрированы возможности и перспективность разработанного подхода для обнаружения потенциальных маркеров РЖ при анализе НМП 69 образцов плазмы крови больных РЖ (I-IV стадии) и 238 контрольных образцов. В результате проведенного исследования обнаружены пептиды/полипептиды, которые могут в перспективе использоваться для детектирования этой патологии
Шевченко В.Е. и др. Поиск потенциальных биомаркеров рака желудка масс-спектрометрическим профилированием низкомолекулярного протеома плазмы крови // Биомедицинская химия. - 2014. - Т. 60. -N 4. - С. 503-514.
Шевченко В.Е. и др., "Поиск потенциальных биомаркеров рака желудка масс-спектрометрическим профилированием низкомолекулярного протеома плазмы крови." Биомедицинская химия 60.4 (2014): 503-514.
Шевченко, В. Е., Арноцкая, Н. Е., Огородникова, Е. В., Давыдов, М. М., Ибраев, М. А., Туркин, И. Н., Давыдов, М. И. (2014). Поиск потенциальных биомаркеров рака желудка масс-спектрометрическим профилированием низкомолекулярного протеома плазмы крови. Биомедицинская химия, 60(4), 503-514.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750813040094
Villanueva J., Philip J., Entenberg D., Chaparro C.A., Tanwar M.K., Holland E.C., Tempst P. (2004) Anal. Chem., 76, 1560-1570. CrossRef Scholar google search
Шевченко В.Е., Арноцкая Н.Е., Трифонова О.П., Дашкевич А.С., Юрченко В.А., Заридзе Д.Г. (2007) Масс-спектрометрия, 4, 245-254. Scholar google search
Dvorak H.F., Nagy J.A., Dvorak J.T., Dvorak A.M. (1988) Am. J. Pathol., 133, 95–109. Scholar google search
Yuan F., Dellian M., Fukumura D., Leunig M., Berk D.A., Torchilin V.P., Jain R.K. (1995) Cancer Res., 55(17), 3752–3756. Scholar google search
Dellian M., Yuan F., Trubetskoy V.S., Torchilin V.P., Jain R.K. (2000) Br. J. Cancer, 82, 1513–1518. CrossRef Scholar google search
Liang Y., Fang M., Li J., Liu C.B., Rudd J.A., Kung H.F., Yew D.T. (2006) Exp. Mol. Pathol., 81, 176-180. CrossRef Scholar google search
Su Y., Shen J., Qian H., Ma H., Ji J., Ma H., Ma L. Zhang W., Meng L., Li Z., Wu J., Jin G., Zhang J., Shou C. (2007) Cancer Sci., 98, 37-43. CrossRef Scholar google search
Lim J.Y., Cho J.Y., Paik Y.H., Chang Y.S., Kim H.G. (2007) Int. J. Biol. Markers, 22, 281-286. Scholar google search
Wang Y.S., Shen J., Yu J.K., Zhang L., Ma J.L., You W.C., Pan K.F. (2008) Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi, 42, 677-680. Scholar google search
Li P., Zhang D., Guo C. (2012) Mol. Med. Report, 5, 1531-1535. Scholar google search
Ebert M.P.A., Niemeyer D., Deininger S.O., Wex T., Knippig C., Hoffmann J., Sauer J., Albrecht W., Knippig P., Rolcken C. (2006) J. Proteome Res., 5, 2152–2158. CrossRef Scholar google search
Fiedler G.M., Baumann S., Leichtle A., Oltmann A., Kase J., Thiery J., Ceglarek U. (2007) Clin. Chem., 53, 421–428. CrossRef Scholar google search
Schaub N.P., Jones K.J., Nyalwidhe J.O., Cazares L.H., Karbassi I.D., Semmes O.J., Feliberti E.C., Perry R.R., Drake R.R. (2009) J. Am. Coll. Surg., 208, 970–978. CrossRef Scholar google search
Schwamborn K., Krieg R.C., Grosse J., Reulen N., Weiskirchen R., Knuechel R., Jakse G., Henkel C. (2009) Eur. Urol., 56, 989–999. CrossRef Scholar google search
Theodorescu D., Wittke S., Ross M.M., Walden M., Conaway M., Just I., Mischak H., Frierson H.F. (2006) Lancet Oncol., 7, 230–240. CrossRef Scholar google search
Orvisky E., Drake S.K., Martin B.M., Abdel-Hamid M., Ressom H., Varghese R.S., An Y., Saha D., Hortin G.L., Loffredo C.A., Goldman R. (2006) Proteomics, 6, 2895–2902. CrossRef Scholar google search
Liu W.T., Gao X., Cai Q., Li J.F., Zhu Z.L., Li C., Yao X.X., Yang Q.M., Xiang M., Yan M., Zhu Z.G. (2010) Front. Biosci., 2, 961–971. CrossRef Scholar google search
Gao X., Liu W.T., Yang Q.M., Liu B.Y., Cai Li., Li J.F., Zhu Z.L., Xiang M., Yan M., Zhu Z.G. (2010) Chin. J. Clin. Oncol., 16, 933–936. Scholar google search
Marshall J., Kupchak P., Zhu W., Yantha J., Vrees T., Furesz S., Jacks K., Smith C., Kireeva I., Zhang R., Takahashi M., Stanton E., Jackowski G. (2003) J. Proteome Res., 2, 361–372. CrossRef Scholar google search
Villanueva J., Shaffer D.R., Philip J., Chaparro C.A., Erdjument-Bromage H., Olshen A.B., Fleisher M., Lilja H., Brogi E., Boyd J., Sanchez-Carbayo M., Holland E.C., Cordon-Cardo C., Scher H.I., Tempst P. (2006) J. Clin. Invest., 116, 271–284. CrossRef Scholar google search
Fung E.T., Yip T.T., Lomas L., Wang Z., Yip C., Meng X.Y., Lin S., Zhang F., Zhang Z., Chan D.W., Weinberger S.R.(2005)Int. J. Cancer, 115, 783-789. CrossRef Scholar google search
Timms J.F., Arslan-Low E., Gentry-Maharaj A., Luo Z., T'Jampens D., Podust V.N., Ford J., Fung E.T., Gammerman A., Jacobs I., Menon U. (2007) Clin. Chem., 53, 645–656. Scholar google search
Villanueva J., Martorella A.J., Lawlor K., Philip J., Fleisher M., Robbins R.J., Tempst P. (2006) Mol. Cell Proteomics, 5, 1840–1852. CrossRef Scholar google search
Ward D.G., Suggett N., Cheng Y., Wei W., Johnson H., Billingham L.J., Ismail T., Wakelam M.J., Johnson P.J., Martin A. (2006) Br. J. Cancer, 94, 1898–1905. CrossRef Scholar google search
Vermeulen R., Lan Q., Zhang L., Gunn L., McCarthy D., Woodbury R.L., McGuire M., Podust V.N., Li G., Chatterjee N., Mu R., Yin S., Rothman N., Smith M.T. (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, 17041–17046. CrossRef Scholar google search
