Достижение концентрационного предела детекции белков на уровне обратного числа Авогадро определяет современное развитие протеомики. В настоящей работе анализируются возможности приближения к достижению обратного числа Авогадро с помощью нанотехнологических методов: АСМ-фишинга с механическим и электрическим возбуждением среды, нанопроводных детекторов, и других методов. Продемонстрирована возможность АСМ-фишинга для выявления, подсчёта, визуализации и характеризации физико-химических свойств белков в концентрациях вплоть до 10-17–10-18 М. Комбинирование АСМ-фишинга с масс-спектрометрическими методами позволяет идентифицировать таким образом выявленные белки не только в чистых растворах, но и в многокомпонентной биологической жидкости (сыворотке крови). Анализируются возможности использования СОМАмеров для повышения эффективности биоспецифического фишинга как в АСМ, так и в нанопроволочных системах. В работе приводятся критерии оценки чувствительности детектирующих систем на основе фишинга. Дается оценка эффективности фишинга в зависимости от параметров детектирующей системы. Анализируются особенности практической реализации фишинга белков в зависимости от соотношения объема анализируемого раствора и поверхности детектирующей системы; обсуждаются преимущества и недостатки современных перспективных нанотехнологических методов обнаружения белков, реализуемых на базе этих схем
Плешакова Т.О., Шумов И.Д., Иванов Ю.Д., Мальсагова К.А., Кайшева А.Л., Арчаков А.И. (2015) АCM-технологии как путь к обратному числу Авогадро. Биомедицинская химия, 61(2), 239-253.
Плешакова Т.О. и др. АCM-технологии как путь к обратному числу Авогадро // Биомедицинская химия. - 2015. - Т. 61. -N 2. - С. 239-253.
Плешакова Т.О. и др., "АCM-технологии как путь к обратному числу Авогадро." Биомедицинская химия 61.2 (2015): 239-253.
Плешакова, Т. О., Шумов, И. Д., Иванов, Ю. Д., Мальсагова, К. А., Кайшева, А. Л., Арчаков, А. И. (2015). АCM-технологии как путь к обратному числу Авогадро. Биомедицинская химия, 61(2), 239-253.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750815030063
Haas P., Then P., Wild A., Grange W., Zorman S., Hegner M., Calame M., Aebi U., Flammer J., Hecht B. (2010) Anal. Chem., 82, 6299-6302. CrossRef Scholar google search
Ivanov Yu.D., Pleshakova T., Malsagova K., Kozlov A., Kaysheva A., Kopylov A., Izotov A., Andreeva E., Kanashenko S., Usanov S., Archakov A. (2014) FEBS J., 281, 4705-4717. Scholar google search
Braga P.C., Ricci D. (2003) Methods in Molecular Biology, 242, Atomic Force Microscopy. Biomedical Methods and Applications. Humana Press, NJ, 382 p. CrossRef Scholar google search
Ivanov Y.D., Frantsuzov P.A., Zöllner A., Medvedeva N.V., Archakov A.I., Reinle W., Bernhardt R. (2010) Nanoscale Res. Lett., 6, 54. Scholar google search
Vu C.C., Pan T.M., Wu C.S., Yen Li-Ch., Chuang Ch.K., Pang S.T., Yang Y.Sh., Ko Fu-H. (2012) Int. J. Electrochem. Sci., 7, 4432-4442. Scholar google search
Zhang G.-J., Chai K.T.Ch., Luo H.Zh.H., Huang J.M., Tay I.G.K., Lim A.E.J., Je M. (2012) Biosens. Bioelectron., 35, 218-223. CrossRef Scholar google search
Yu Y., Cimeno A., Lan Y.C., Rybczynski J., Wang D.Z., Paudel T., Ren Z.F. et al. (2009) Micro&Nano Lett., 4, 27-33. CrossRef Scholar google search
Ferreira J., Santos M.J.L., Rahman M.M., Brolo A.G., Gordon R., Sinton D., Girotto E.M. (2009) J. Am. Chem. Soc., 131, 436-437. CrossRef Scholar google search
Siawaya D.J.F., Roberts T., Babb Ch., Black G., Golakai H.J., Stantey K. et al. (2008) PlosOne, 3, e2535. CrossRef Scholar google search
Todd J., Freese B., Lu A., Held D., Morey J., Livingston R., Goix P. (2007) Clin. Chem., 53, 1990-1995. CrossRef Scholar google search
Song L., Hanlon D.W., Chang L., Provuncher G.K., Kan C.W., Campbell T.G., et al. (2011) J. IMMunol. Methods, 372, 177-186. CrossRef Scholar google search
Kim S.H., Iwai Sh., Araki S., Sakakihara Sh., Iino R., Noji H. (2012) Lab Chip, 12, 4986-4991. CrossRef Scholar google search
