Обобщены результаты многолетней работы по исследованию структуры активных центров моноаминоксидаз (МАО) методами компьютерного моделирования, выполненных в Институте биомедицинской химии (ИБМХ). МАО присутствует в организме млекопитающих в виде двух высокогомологичных белков (МАО А и МАО Б), отличающихся по субстратной специфичности, ингибиторной селективности и другим свойствам. Показано развитие подходов по моделированию структуры активных центров ферментов с неизвестной пространственной структурой на основе селективных ингибиторов. Отправной точкой исследований послужила обнаруженная зависимость между геометрическими размерами конформационно жёстких молекул ингибиторов и величиной их ингибиторной активности. Последующие работы привели к созданию модели слепка активного центра, который отражал геометрические размеры и форму активного центра. Показана возможность его использования для поиска новых ингибиторов в молекулярных базах данных. Приведены результаты работы по поиску селективных и неселективных ингибиторов МАО. Проведено сравнение полученных моделей со структурой активных центров кристаллических структур МАО, полученных позднее.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: моноаминоксидаза, МАО, компьютерное моделирование, активный центр, ингибиторы
Ivanov A.S., Medvedev A.E., Lyulkin Y.A., Skvortsov V.S., Rumjantsev A.B., Gorkin V.Z. (1994) In: 14th European workshop on drug metabolism, Paris, France, 4-8 July 1994, 66. Scholar google search
Wouters J., Moureau F., Vercauteren D.P., Evrard G., Durant F., Koenig J.J., Ducrey F., Jarreau F.X. (1994) J. Neural. Transmission, Suppl., 41, 313-319. Scholar google search
Веселовский А.В., Иванов А.С., Медведев А.Е. (1997) Вопр. мед. химии, 43, 527-536. Scholar google search
Altomare C., Carrupt P.A., Gaillard P., el Tayar N., Testa B., Carotti A. (1992) Chem. Res. Toxicol., 5, 366-375. CrossRef Scholar google search
Altomare C., Cellamare S., Summo L., Catto M., Carotti A., Thull U., Carrupt P.A., Testa B., Stoeckli-Evans H. (1998) J. Med. Chem., 41, 3812-3820. CrossRef Scholar google search
Ooms F., Wouters J., Collin S., Durant F., Jegham S., George P. (1998) Bioorg. Med. Chem. Lett., 8, 1425-1430. CrossRef Scholar google search
Веселовский А.В., Иванов А.С., Медведев А.Е. (1998) Биохимия, 63, 1695-1701. Scholar google search
Медведев А.Е., Иванов А.С., Веселовский А.В. (2001) Биохимия, 66, 718-720. Scholar google search
Ivanov A.S., Veselovsky A.V., Dubanov A.V., Skvortsov V.S. (2006) In: Methods in Molecular Biology, 316. Bioinformatics and Drug Discovery. (Larson R.S., ed.) Humana Press Inc., Totowa, NJ, USA, pp. 389-431. CrossRef Scholar google search
Скворцов В.С., Иванов А.С., Белкина Н.В., Сеченых А.А., Шкроб А.М., Веселовский А.В. (2005) DockSearch 3.2, Роспатент, N 2005610707 от 27.01.05. Scholar google search
Glover V. (1997) In: Antidepressants: New Pharmacological Strategies (Skolnick Ph., ed.) Humana Press, Totowa, NJ, USA, pp. 69-80. CrossRef Scholar google search
