1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия; Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова, Москва, Россия 2. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия 3. Департамент фармацевтических наук и исследований лекарств, Университет Пенджаба, Патиала-147002, Индия
Исследована применимость разработанных нами компьютерных программ PASS и PharmaExpert к анализу спектров биологической активности достаточно сложных и разнообразных по структуре фитокомпонентов лекарственных растений, как по-отдельности, так и в комбинациях. С этой целью была создана база данных, содержащая известную информацию о структурных формулах и биологической активности 1906 фитокомпонентов 50 лекарственных растений из традиционной индийской медицины (ТИМ) Аюрведа (ayurveda.pharmaexpert.ru). Обучающая выборка программы PASS была пополнена информацией о структуре и биологической активности 946 природных соединений; проведены обучение и валидация, позволившие оценить качество прогноза PASS. Показано, что различия между значениями средней точности прогноза при кросс-валидации с разбиением выборки на 20 частей (94,467%) и при скользящем контроле с исключением по одному (94,605%) незначительны, что свидетельствует о хорошей прогностической способности программы. Результаты прогноза спектров биологической активности для всех включенных в нашу базу данных фитокомпонентов в 83,5% случаев совпали с известными экспериментальными данными. Предсказанные с высокой вероятностью дополнительные виды активности указывают на перспективные направления дальнейших исследований отдельных фитокомпонентов лекарственных растений. С помощью компьютерной программы PharmaExpert мы выполнили анализ результатов прогноза для комбинаций фитокомпонентов, содержащихся в отдельных лекарственных растениях ТИМ. На основе этого анализа установлено, что комбинация фитокомпонентов растения Passiflora incarnata может обладать ноотропным, противосудорожным и антидепрессантным эффектами. Полученные в экспериментах на мышиных моделях результаты подтвердили наличие прогнозируемых видов биологической активности у экстрактов Passiflora incarnata.
Лагунин А.А., Дружиловский Д.С., Рудик А.В., Филимонов Д.А., Гаванде Д., Суреш К., Гоел Р., Поройков В.В. (2015) Возможности компьютерной оценки скрытого потенциала фитокомпонентов лекарственных растений из традиционной индийской медицины Аюрведа. Биомедицинская химия, 61(2), 286-297.
Лагунин А.А. и др. Возможности компьютерной оценки скрытого потенциала фитокомпонентов лекарственных растений из традиционной индийской медицины Аюрведа // Биомедицинская химия. - 2015. - Т. 61. -N 2. - С. 286-297.
Лагунин А.А. и др., "Возможности компьютерной оценки скрытого потенциала фитокомпонентов лекарственных растений из традиционной индийской медицины Аюрведа." Биомедицинская химия 61.2 (2015): 286-297.
Лагунин, А. А., Дружиловский, Д. С., Рудик, А. В., Филимонов, Д. А., Гаванде, Д., Суреш, К., Гоел, Р., Поройков, В. В. (2015). Возможности компьютерной оценки скрытого потенциала фитокомпонентов лекарственных растений из традиционной индийской медицины Аюрведа. Биомедицинская химия, 61(2), 286-297.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750816010091
Ivanov A.S., Veselovsky A.V., Dubanov A.V., Skvortsov V.S. (2006) in: Methods in Molecular Biology (Larson E., Richard S., eds.), 116, Humana Press, pp. 389-431. Scholar google search
Иванов А.С., Поройков В.В., Арчаков А.И. (2003) Вестник РГМУ, №4, 19-23. Scholar google search
Filimonov D.A., Poroikov V.V. (1996) in: Bioactive Compound Design: Possibilities for Industrial Use, BIOS Scientific Publishers, Oxford (UK), pp. 47-56. Scholar google search
Филимонов Д.А., Поройков В.В., Глориозова Т.А., Лагунин А.А. (2006) Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ PASS № 2006613275 от 15 сентября 2006 г., Москва, Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам. Scholar google search
Filimonov D.A., Poroikov V.V. (2008) in: Chemoinformatics Approaches to Virtual Screening (Varnek A., Tropsha A., eds.), RSC Publishing, Cambridge (UK). pp. 182-216. CrossRef Scholar google search
Poroikov V., Lagunin A., Filimonov D. (2005) in: QSAR and Molecular Modelling in Rational Design of Bioactive Molecules (Esin Aki Sener, Ismail Yalcin, eds.). CADD & D Society, Ankara (Turkey), pp. 514-515. Scholar google search
Лагунин А.А., Поройков В.В., Филимонов Д.А., Глориозова Т.А. (2006) Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ PharmaExpert №2006613590 от 16 октября 2006 г., Москва, Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам. Scholar google search
Zakharov A., Lagunin A. (2014) In: Application of Computational Techniques in Pharmacy and Medicine (Gorb L.,Kuz’min V.,Muratov E., eds.) Springer, p. 325-367. CrossRef Scholar google search
Viswanathan M.V., Unnikrishnan P.M., Komatsu K., Fushimi H., Basnet P. (2003) Ind. J. Tradit. Knowledge, 2, 159-169. Scholar google search
